Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRABDQ9H4I3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRABDQ9H4I3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRABDQ9H4I3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRABDQ9H4I3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TRABDQ9H4I3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TRABDQ9H4I3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TRABDQ9H4I3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TRABDQ9H4I3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRABDQ9H4I3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRABDQ9H4I3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRABDQ9H4I3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRABDQ9H4I3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRABDQ9H4I3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRABDQ9H4I3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRABDQ9H4I3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRABDQ9H4I3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRABDQ9H4I3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRABDQ9H4I3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRABDQ9H4I3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRABDQ9H4I3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRABDQ9H4I3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRABDQ9H4I3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRABDQ9H4I3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRABDQ9H4I3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRABDQ9H4I3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRABDQ9H4I3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRABDQ9H4I3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRABDQ9H4I3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRABDQ9H4I3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRABDQ9H4I3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRABDQ9H4I3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRABDQ9H4I3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRABDQ9H4I3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRABDQ9H4I3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRABDQ9H4I3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRABDQ9H4I3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRABDQ9H4I3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRABDQ9H4I3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRABDQ9H4I3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRABDQ9H4I3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRABDQ9H4I3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRABDQ9H4I3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRABDQ9H4I3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRABDQ9H4I3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRABDQ9H4I3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRABDQ9H4I3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRABDQ9H4I3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRABDQ9H4I3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRABDQ9H4I3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRABDQ9H4I3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRABDQ9H4I3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRABDQ9H4I3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRABDQ9H4I3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRABDQ9H4I3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRABDQ9H4I3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TRABDQ9H4I3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRABDQ9H4I3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRABDQ9H4I3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRABDQ9H4I3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRABDQ9H4I3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRABDQ9H4I3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRABDQ9H4I3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRABDQ9H4I3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRABDQ9H4I3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRABDQ9H4I3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRABDQ9H4I3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRABDQ9H4I3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TRABDQ9H4I3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRABDQ9H4I3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TRABDQ9H4I3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRABDQ9H4I3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRABDQ9H4I3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRABDQ9H4I3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRABDQ9H4I3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRABDQ9H4I3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRABDQ9H4I3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRABDQ9H4I3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRABDQ9H4I3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRABDQ9H4I3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRABDQ9H4I3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRABDQ9H4I3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRABDQ9H4I3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRABDQ9H4I3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRABDQ9H4I3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRABDQ9H4I3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRABDQ9H4I3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRABDQ9H4I3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRABDQ9H4I3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRABDQ9H4I3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRABDQ9H4I3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRABDQ9H4I3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRABDQ9H4I3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRABDQ9H4I3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TRABDQ9H4I3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRABDQ9H4I3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRABDQ9H4I3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRABDQ9H4I3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRABDQ9H4I3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRABDQ9H4I3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
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