Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3S4

TPK1, Thiamin pyrophosphokinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPK1Q9H3S4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPK1Q9H3S4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPK1Q9H3S4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPK1Q9H3S4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPK1Q9H3S4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPK1Q9H3S4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPK1Q9H3S4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPK1Q9H3S4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPK1Q9H3S4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPK1Q9H3S4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPK1Q9H3S4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPK1Q9H3S4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPK1Q9H3S4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPK1Q9H3S4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPK1Q9H3S4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPK1Q9H3S4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPK1Q9H3S4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPK1Q9H3S4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPK1Q9H3S4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPK1Q9H3S4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPK1Q9H3S4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPK1Q9H3S4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPK1Q9H3S4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPK1Q9H3S4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TPK1Q9H3S4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPK1Q9H3S4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPK1Q9H3S4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPK1Q9H3S4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPK1Q9H3S4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPK1Q9H3S4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPK1Q9H3S4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPK1Q9H3S4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPK1Q9H3S4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPK1Q9H3S4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPK1Q9H3S4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPK1Q9H3S4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPK1Q9H3S4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPK1Q9H3S4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPK1Q9H3S4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPK1Q9H3S4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPK1Q9H3S4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPK1Q9H3S4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPK1Q9H3S4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPK1Q9H3S4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPK1Q9H3S4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TPK1Q9H3S4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPK1Q9H3S4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPK1Q9H3S4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPK1Q9H3S4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPK1Q9H3S4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPK1Q9H3S4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPK1Q9H3S4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPK1Q9H3S4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPK1Q9H3S4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPK1Q9H3S4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPK1Q9H3S4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPK1Q9H3S4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPK1Q9H3S4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TPK1Q9H3S4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPK1Q9H3S4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPK1Q9H3S4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPK1Q9H3S4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPK1Q9H3S4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPK1Q9H3S4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPK1Q9H3S4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPK1Q9H3S4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPK1Q9H3S4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPK1Q9H3S4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPK1Q9H3S4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPK1Q9H3S4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPK1Q9H3S4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPK1Q9H3S4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPK1Q9H3S4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TPK1Q9H3S4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPK1Q9H3S4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPK1Q9H3S4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPK1Q9H3S4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPK1Q9H3S4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPK1Q9H3S4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPK1Q9H3S4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPK1Q9H3S4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPK1Q9H3S4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPK1Q9H3S4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPK1Q9H3S4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TPK1Q9H3S4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPK1Q9H3S4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPK1Q9H3S4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPK1Q9H3S4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPK1Q9H3S4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPK1Q9H3S4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPK1Q9H3S4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPK1Q9H3S4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TPK1Q9H3S4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPK1Q9H3S4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPK1Q9H3S4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPK1Q9H3S4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPK1Q9H3S4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPK1Q9H3S4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPK1Q9H3S4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPK1Q9H3S4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms