Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN2

TGIF2, Homeobox protein TGIF2, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGIF2Q9GZN2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TGIF2Q9GZN2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGIF2Q9GZN2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGIF2Q9GZN2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGIF2Q9GZN2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGIF2Q9GZN2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGIF2Q9GZN2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGIF2Q9GZN2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGIF2Q9GZN2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TGIF2Q9GZN2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGIF2Q9GZN2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGIF2Q9GZN2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGIF2Q9GZN2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGIF2Q9GZN2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGIF2Q9GZN2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGIF2Q9GZN2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGIF2Q9GZN2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGIF2Q9GZN2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TGIF2Q9GZN2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGIF2Q9GZN2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGIF2Q9GZN2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGIF2Q9GZN2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGIF2Q9GZN2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TGIF2Q9GZN2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGIF2Q9GZN2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGIF2Q9GZN2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGIF2Q9GZN2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGIF2Q9GZN2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGIF2Q9GZN2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGIF2Q9GZN2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGIF2Q9GZN2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGIF2Q9GZN2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGIF2Q9GZN2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGIF2Q9GZN2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGIF2Q9GZN2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TGIF2Q9GZN2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TGIF2Q9GZN2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TGIF2Q9GZN2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TGIF2Q9GZN2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TGIF2Q9GZN2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TGIF2Q9GZN2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TGIF2Q9GZN2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TGIF2Q9GZN2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TGIF2Q9GZN2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGIF2Q9GZN2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGIF2Q9GZN2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGIF2Q9GZN2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGIF2Q9GZN2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGIF2Q9GZN2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGIF2Q9GZN2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGIF2Q9GZN2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TGIF2Q9GZN2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TGIF2Q9GZN2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TGIF2Q9GZN2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TGIF2Q9GZN2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TGIF2Q9GZN2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TGIF2Q9GZN2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TGIF2Q9GZN2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TGIF2Q9GZN2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TGIF2Q9GZN2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TGIF2Q9GZN2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TGIF2Q9GZN2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TGIF2Q9GZN2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TGIF2Q9GZN2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TGIF2Q9GZN2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TGIF2Q9GZN2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGIF2Q9GZN2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGIF2Q9GZN2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGIF2Q9GZN2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGIF2Q9GZN2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGIF2Q9GZN2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGIF2Q9GZN2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TGIF2Q9GZN2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TGIF2Q9GZN2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TGIF2Q9GZN2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TGIF2Q9GZN2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TGIF2Q9GZN2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TGIF2Q9GZN2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TGIF2Q9GZN2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TGIF2Q9GZN2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TGIF2Q9GZN2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TGIF2Q9GZN2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TGIF2Q9GZN2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TGIF2Q9GZN2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TGIF2Q9GZN2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TGIF2Q9GZN2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TGIF2Q9GZN2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TGIF2Q9GZN2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TGIF2Q9GZN2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TGIF2Q9GZN2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TGIF2Q9GZN2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TGIF2Q9GZN2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TGIF2Q9GZN2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TGIF2Q9GZN2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TGIF2Q9GZN2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TGIF2Q9GZN2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TGIF2Q9GZN2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TGIF2Q9GZN2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TGIF2Q9GZN2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TGIF2Q9GZN2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms