Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM7Q9C029 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM7Q9C029 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM7Q9C029 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM7Q9C029 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM7Q9C029 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM7Q9C029 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM7Q9C029 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM7Q9C029 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM7Q9C029 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM7Q9C029 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM7Q9C029 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM7Q9C029 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM7Q9C029 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM7Q9C029 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM7Q9C029 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM7Q9C029 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM7Q9C029 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM7Q9C029 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM7Q9C029 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM7Q9C029 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM7Q9C029 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM7Q9C029 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM7Q9C029 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM7Q9C029 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM7Q9C029 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TRIM7Q9C029 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM7Q9C029 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM7Q9C029 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM7Q9C029 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM7Q9C029 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM7Q9C029 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM7Q9C029 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM7Q9C029 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM7Q9C029 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM7Q9C029 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM7Q9C029 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM7Q9C029 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM7Q9C029 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM7Q9C029 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM7Q9C029 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM7Q9C029 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM7Q9C029 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM7Q9C029 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM7Q9C029 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM7Q9C029 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM7Q9C029 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM7Q9C029 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM7Q9C029 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM7Q9C029 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM7Q9C029 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM7Q9C029 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM7Q9C029 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM7Q9C029 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM7Q9C029 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM7Q9C029 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM7Q9C029 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM7Q9C029 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM7Q9C029 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM7Q9C029 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM7Q9C029 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM7Q9C029 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM7Q9C029 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM7Q9C029 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
TRIM7Q9C029 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM7Q9C029 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM7Q9C029 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM7Q9C029 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM7Q9C029 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM7Q9C029 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM7Q9C029 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM7Q9C029 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM7Q9C029 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM7Q9C029 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM7Q9C029 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM7Q9C029 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM7Q9C029 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM7Q9C029 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM7Q9C029 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM7Q9C029 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM7Q9C029 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM7Q9C029 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM7Q9C029 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM7Q9C029 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM7Q9C029 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM7Q9C029 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM7Q9C029 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM7Q9C029 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM7Q9C029 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM7Q9C029 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM7Q9C029 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM7Q9C029 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM7Q9C029 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM7Q9C029 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM7Q9C029 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRIM7Q9C029 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRIM7Q9C029 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM7Q9C029 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM7Q9C029 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM7Q9C029 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms