Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW2

SLC13A1, Solute carrier family 13 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A1Q9BZW2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC13A1Q9BZW2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC13A1Q9BZW2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC13A1Q9BZW2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC13A1Q9BZW2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC13A1Q9BZW2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC13A1Q9BZW2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC13A1Q9BZW2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC13A1Q9BZW2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC13A1Q9BZW2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC13A1Q9BZW2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC13A1Q9BZW2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC13A1Q9BZW2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC13A1Q9BZW2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC13A1Q9BZW2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC13A1Q9BZW2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC13A1Q9BZW2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC13A1Q9BZW2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC13A1Q9BZW2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC13A1Q9BZW2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC13A1Q9BZW2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC13A1Q9BZW2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC13A1Q9BZW2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC13A1Q9BZW2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC13A1Q9BZW2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC13A1Q9BZW2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC13A1Q9BZW2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC13A1Q9BZW2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC13A1Q9BZW2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC13A1Q9BZW2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC13A1Q9BZW2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC13A1Q9BZW2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC13A1Q9BZW2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC13A1Q9BZW2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC13A1Q9BZW2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC13A1Q9BZW2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC13A1Q9BZW2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC13A1Q9BZW2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC13A1Q9BZW2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC13A1Q9BZW2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC13A1Q9BZW2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC13A1Q9BZW2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC13A1Q9BZW2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC13A1Q9BZW2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC13A1Q9BZW2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC13A1Q9BZW2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC13A1Q9BZW2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC13A1Q9BZW2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC13A1Q9BZW2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC13A1Q9BZW2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC13A1Q9BZW2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC13A1Q9BZW2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC13A1Q9BZW2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC13A1Q9BZW2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC13A1Q9BZW2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC13A1Q9BZW2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC13A1Q9BZW2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC13A1Q9BZW2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC13A1Q9BZW2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC13A1Q9BZW2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC13A1Q9BZW2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC13A1Q9BZW2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC13A1Q9BZW2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC13A1Q9BZW2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC13A1Q9BZW2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC13A1Q9BZW2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC13A1Q9BZW2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC13A1Q9BZW2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC13A1Q9BZW2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC13A1Q9BZW2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC13A1Q9BZW2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC13A1Q9BZW2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC13A1Q9BZW2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC13A1Q9BZW2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC13A1Q9BZW2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC13A1Q9BZW2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC13A1Q9BZW2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC13A1Q9BZW2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC13A1Q9BZW2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC13A1Q9BZW2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC13A1Q9BZW2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC13A1Q9BZW2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC13A1Q9BZW2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC13A1Q9BZW2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC13A1Q9BZW2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC13A1Q9BZW2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC13A1Q9BZW2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC13A1Q9BZW2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC13A1Q9BZW2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC13A1Q9BZW2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC13A1Q9BZW2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC13A1Q9BZW2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC13A1Q9BZW2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC13A1Q9BZW2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC13A1Q9BZW2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC13A1Q9BZW2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC13A1Q9BZW2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC13A1Q9BZW2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC13A1Q9BZW2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC13A1Q9BZW2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms