Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZM3

GSX2, GS homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSX2Q9BZM3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GSX2Q9BZM3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GSX2Q9BZM3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GSX2Q9BZM3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GSX2Q9BZM3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GSX2Q9BZM3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GSX2Q9BZM3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GSX2Q9BZM3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GSX2Q9BZM3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GSX2Q9BZM3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GSX2Q9BZM3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GSX2Q9BZM3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GSX2Q9BZM3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GSX2Q9BZM3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GSX2Q9BZM3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GSX2Q9BZM3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GSX2Q9BZM3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GSX2Q9BZM3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GSX2Q9BZM3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GSX2Q9BZM3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GSX2Q9BZM3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GSX2Q9BZM3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GSX2Q9BZM3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GSX2Q9BZM3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GSX2Q9BZM3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GSX2Q9BZM3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GSX2Q9BZM3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GSX2Q9BZM3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GSX2Q9BZM3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GSX2Q9BZM3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GSX2Q9BZM3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GSX2Q9BZM3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GSX2Q9BZM3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GSX2Q9BZM3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GSX2Q9BZM3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GSX2Q9BZM3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GSX2Q9BZM3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GSX2Q9BZM3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GSX2Q9BZM3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GSX2Q9BZM3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GSX2Q9BZM3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GSX2Q9BZM3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GSX2Q9BZM3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GSX2Q9BZM3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GSX2Q9BZM3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GSX2Q9BZM3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GSX2Q9BZM3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GSX2Q9BZM3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GSX2Q9BZM3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GSX2Q9BZM3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GSX2Q9BZM3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GSX2Q9BZM3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GSX2Q9BZM3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GSX2Q9BZM3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GSX2Q9BZM3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GSX2Q9BZM3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GSX2Q9BZM3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GSX2Q9BZM3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
GSX2Q9BZM3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GSX2Q9BZM3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GSX2Q9BZM3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GSX2Q9BZM3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GSX2Q9BZM3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GSX2Q9BZM3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GSX2Q9BZM3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GSX2Q9BZM3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GSX2Q9BZM3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GSX2Q9BZM3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GSX2Q9BZM3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GSX2Q9BZM3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GSX2Q9BZM3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GSX2Q9BZM3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSX2Q9BZM3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSX2Q9BZM3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSX2Q9BZM3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GSX2Q9BZM3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSX2Q9BZM3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSX2Q9BZM3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GSX2Q9BZM3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSX2Q9BZM3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSX2Q9BZM3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSX2Q9BZM3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSX2Q9BZM3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSX2Q9BZM3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSX2Q9BZM3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSX2Q9BZM3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSX2Q9BZM3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSX2Q9BZM3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSX2Q9BZM3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSX2Q9BZM3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSX2Q9BZM3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSX2Q9BZM3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSX2Q9BZM3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSX2Q9BZM3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSX2Q9BZM3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSX2Q9BZM3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GSX2Q9BZM3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GSX2Q9BZM3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GSX2Q9BZM3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GSX2Q9BZM3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms