Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWQ6

YIPF2, Protein YIPF2, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF2Q9BWQ6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
YIPF2Q9BWQ6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
YIPF2Q9BWQ6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
YIPF2Q9BWQ6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
YIPF2Q9BWQ6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
YIPF2Q9BWQ6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
YIPF2Q9BWQ6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
YIPF2Q9BWQ6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YIPF2Q9BWQ6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YIPF2Q9BWQ6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YIPF2Q9BWQ6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YIPF2Q9BWQ6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YIPF2Q9BWQ6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YIPF2Q9BWQ6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YIPF2Q9BWQ6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YIPF2Q9BWQ6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YIPF2Q9BWQ6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YIPF2Q9BWQ6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
YIPF2Q9BWQ6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YIPF2Q9BWQ6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YIPF2Q9BWQ6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YIPF2Q9BWQ6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YIPF2Q9BWQ6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YIPF2Q9BWQ6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YIPF2Q9BWQ6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
YIPF2Q9BWQ6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
YIPF2Q9BWQ6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
YIPF2Q9BWQ6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
YIPF2Q9BWQ6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
YIPF2Q9BWQ6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
YIPF2Q9BWQ6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
YIPF2Q9BWQ6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
YIPF2Q9BWQ6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
YIPF2Q9BWQ6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
YIPF2Q9BWQ6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
YIPF2Q9BWQ6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
YIPF2Q9BWQ6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YIPF2Q9BWQ6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
YIPF2Q9BWQ6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YIPF2Q9BWQ6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YIPF2Q9BWQ6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
YIPF2Q9BWQ6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YIPF2Q9BWQ6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
YIPF2Q9BWQ6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
YIPF2Q9BWQ6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
YIPF2Q9BWQ6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
YIPF2Q9BWQ6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
YIPF2Q9BWQ6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
YIPF2Q9BWQ6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
YIPF2Q9BWQ6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
YIPF2Q9BWQ6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
YIPF2Q9BWQ6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
YIPF2Q9BWQ6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
YIPF2Q9BWQ6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
YIPF2Q9BWQ6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YIPF2Q9BWQ6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
YIPF2Q9BWQ6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
YIPF2Q9BWQ6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
YIPF2Q9BWQ6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YIPF2Q9BWQ6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YIPF2Q9BWQ6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YIPF2Q9BWQ6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YIPF2Q9BWQ6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YIPF2Q9BWQ6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YIPF2Q9BWQ6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
YIPF2Q9BWQ6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
YIPF2Q9BWQ6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
YIPF2Q9BWQ6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
YIPF2Q9BWQ6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
YIPF2Q9BWQ6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
YIPF2Q9BWQ6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
YIPF2Q9BWQ6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
YIPF2Q9BWQ6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
YIPF2Q9BWQ6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YIPF2Q9BWQ6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YIPF2Q9BWQ6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YIPF2Q9BWQ6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YIPF2Q9BWQ6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
YIPF2Q9BWQ6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
YIPF2Q9BWQ6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
YIPF2Q9BWQ6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
YIPF2Q9BWQ6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YIPF2Q9BWQ6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YIPF2Q9BWQ6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
YIPF2Q9BWQ6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
YIPF2Q9BWQ6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YIPF2Q9BWQ6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
YIPF2Q9BWQ6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YIPF2Q9BWQ6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YIPF2Q9BWQ6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YIPF2Q9BWQ6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YIPF2Q9BWQ6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YIPF2Q9BWQ6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YIPF2Q9BWQ6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YIPF2Q9BWQ6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YIPF2Q9BWQ6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YIPF2Q9BWQ6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YIPF2Q9BWQ6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YIPF2Q9BWQ6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YIPF2Q9BWQ6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms