Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PBDC1Q9BVG4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PBDC1Q9BVG4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PBDC1Q9BVG4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PBDC1Q9BVG4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PBDC1Q9BVG4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PBDC1Q9BVG4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PBDC1Q9BVG4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PBDC1Q9BVG4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PBDC1Q9BVG4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PBDC1Q9BVG4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PBDC1Q9BVG4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PBDC1Q9BVG4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PBDC1Q9BVG4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PBDC1Q9BVG4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PBDC1Q9BVG4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PBDC1Q9BVG4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PBDC1Q9BVG4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PBDC1Q9BVG4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PBDC1Q9BVG4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PBDC1Q9BVG4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PBDC1Q9BVG4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PBDC1Q9BVG4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PBDC1Q9BVG4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PBDC1Q9BVG4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PBDC1Q9BVG4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PBDC1Q9BVG4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PBDC1Q9BVG4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PBDC1Q9BVG4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PBDC1Q9BVG4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PBDC1Q9BVG4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PBDC1Q9BVG4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PBDC1Q9BVG4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PBDC1Q9BVG4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PBDC1Q9BVG4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PBDC1Q9BVG4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PBDC1Q9BVG4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PBDC1Q9BVG4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PBDC1Q9BVG4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PBDC1Q9BVG4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PBDC1Q9BVG4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PBDC1Q9BVG4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PBDC1Q9BVG4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PBDC1Q9BVG4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PBDC1Q9BVG4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PBDC1Q9BVG4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PBDC1Q9BVG4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PBDC1Q9BVG4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PBDC1Q9BVG4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PBDC1Q9BVG4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PBDC1Q9BVG4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PBDC1Q9BVG4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PBDC1Q9BVG4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PBDC1Q9BVG4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PBDC1Q9BVG4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PBDC1Q9BVG4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PBDC1Q9BVG4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PBDC1Q9BVG4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PBDC1Q9BVG4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PBDC1Q9BVG4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PBDC1Q9BVG4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PBDC1Q9BVG4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PBDC1Q9BVG4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PBDC1Q9BVG4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PBDC1Q9BVG4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PBDC1Q9BVG4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PBDC1Q9BVG4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PBDC1Q9BVG4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PBDC1Q9BVG4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PBDC1Q9BVG4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PBDC1Q9BVG4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PBDC1Q9BVG4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PBDC1Q9BVG4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PBDC1Q9BVG4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PBDC1Q9BVG4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PBDC1Q9BVG4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PBDC1Q9BVG4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PBDC1Q9BVG4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PBDC1Q9BVG4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PBDC1Q9BVG4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PBDC1Q9BVG4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PBDC1Q9BVG4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PBDC1Q9BVG4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PBDC1Q9BVG4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PBDC1Q9BVG4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PBDC1Q9BVG4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PBDC1Q9BVG4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PBDC1Q9BVG4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PBDC1Q9BVG4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PBDC1Q9BVG4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PBDC1Q9BVG4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PBDC1Q9BVG4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PBDC1Q9BVG4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PBDC1Q9BVG4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PBDC1Q9BVG4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PBDC1Q9BVG4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PBDC1Q9BVG4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PBDC1Q9BVG4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PBDC1Q9BVG4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PBDC1Q9BVG4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms