Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK0

REEP2, Receptor expression-enhancing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP2Q9BRK0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
REEP2Q9BRK0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
REEP2Q9BRK0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
REEP2Q9BRK0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
REEP2Q9BRK0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
REEP2Q9BRK0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
REEP2Q9BRK0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
REEP2Q9BRK0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
REEP2Q9BRK0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
REEP2Q9BRK0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
REEP2Q9BRK0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
REEP2Q9BRK0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
REEP2Q9BRK0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
REEP2Q9BRK0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
REEP2Q9BRK0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
REEP2Q9BRK0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
REEP2Q9BRK0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
REEP2Q9BRK0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.52■■■□□ 2
REEP2Q9BRK0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
REEP2Q9BRK0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
REEP2Q9BRK0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
REEP2Q9BRK0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
REEP2Q9BRK0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
REEP2Q9BRK0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
REEP2Q9BRK0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
REEP2Q9BRK0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
REEP2Q9BRK0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
REEP2Q9BRK0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
REEP2Q9BRK0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
REEP2Q9BRK0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
REEP2Q9BRK0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
REEP2Q9BRK0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
REEP2Q9BRK0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
REEP2Q9BRK0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
REEP2Q9BRK0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
REEP2Q9BRK0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
REEP2Q9BRK0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
REEP2Q9BRK0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
REEP2Q9BRK0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
REEP2Q9BRK0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
REEP2Q9BRK0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
REEP2Q9BRK0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
REEP2Q9BRK0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
REEP2Q9BRK0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
REEP2Q9BRK0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
REEP2Q9BRK0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
REEP2Q9BRK0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
REEP2Q9BRK0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
REEP2Q9BRK0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
REEP2Q9BRK0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
REEP2Q9BRK0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
REEP2Q9BRK0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
REEP2Q9BRK0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
REEP2Q9BRK0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
REEP2Q9BRK0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
REEP2Q9BRK0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
REEP2Q9BRK0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
REEP2Q9BRK0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
REEP2Q9BRK0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
REEP2Q9BRK0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
REEP2Q9BRK0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
REEP2Q9BRK0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
REEP2Q9BRK0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
REEP2Q9BRK0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
REEP2Q9BRK0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
REEP2Q9BRK0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
REEP2Q9BRK0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
REEP2Q9BRK0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
REEP2Q9BRK0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
REEP2Q9BRK0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
REEP2Q9BRK0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
REEP2Q9BRK0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
REEP2Q9BRK0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
REEP2Q9BRK0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
REEP2Q9BRK0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
REEP2Q9BRK0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
REEP2Q9BRK0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
REEP2Q9BRK0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
REEP2Q9BRK0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
REEP2Q9BRK0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
REEP2Q9BRK0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
REEP2Q9BRK0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
REEP2Q9BRK0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
REEP2Q9BRK0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
REEP2Q9BRK0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
REEP2Q9BRK0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
REEP2Q9BRK0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
REEP2Q9BRK0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
REEP2Q9BRK0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
REEP2Q9BRK0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
REEP2Q9BRK0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
REEP2Q9BRK0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
REEP2Q9BRK0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
REEP2Q9BRK0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
REEP2Q9BRK0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
REEP2Q9BRK0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
REEP2Q9BRK0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
REEP2Q9BRK0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
REEP2Q9BRK0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
REEP2Q9BRK0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms