Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ7

RTP3, Receptor-transporting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP3Q9BQQ7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RTP3Q9BQQ7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RTP3Q9BQQ7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RTP3Q9BQQ7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RTP3Q9BQQ7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RTP3Q9BQQ7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RTP3Q9BQQ7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RTP3Q9BQQ7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RTP3Q9BQQ7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RTP3Q9BQQ7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTP3Q9BQQ7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTP3Q9BQQ7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTP3Q9BQQ7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTP3Q9BQQ7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTP3Q9BQQ7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTP3Q9BQQ7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTP3Q9BQQ7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTP3Q9BQQ7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTP3Q9BQQ7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTP3Q9BQQ7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTP3Q9BQQ7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTP3Q9BQQ7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RTP3Q9BQQ7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RTP3Q9BQQ7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RTP3Q9BQQ7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RTP3Q9BQQ7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTP3Q9BQQ7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RTP3Q9BQQ7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RTP3Q9BQQ7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RTP3Q9BQQ7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTP3Q9BQQ7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTP3Q9BQQ7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTP3Q9BQQ7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTP3Q9BQQ7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTP3Q9BQQ7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTP3Q9BQQ7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTP3Q9BQQ7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RTP3Q9BQQ7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTP3Q9BQQ7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RTP3Q9BQQ7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RTP3Q9BQQ7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RTP3Q9BQQ7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RTP3Q9BQQ7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RTP3Q9BQQ7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RTP3Q9BQQ7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RTP3Q9BQQ7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RTP3Q9BQQ7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RTP3Q9BQQ7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RTP3Q9BQQ7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RTP3Q9BQQ7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RTP3Q9BQQ7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RTP3Q9BQQ7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RTP3Q9BQQ7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RTP3Q9BQQ7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RTP3Q9BQQ7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RTP3Q9BQQ7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RTP3Q9BQQ7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RTP3Q9BQQ7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RTP3Q9BQQ7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RTP3Q9BQQ7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RTP3Q9BQQ7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RTP3Q9BQQ7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RTP3Q9BQQ7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RTP3Q9BQQ7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RTP3Q9BQQ7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RTP3Q9BQQ7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RTP3Q9BQQ7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RTP3Q9BQQ7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RTP3Q9BQQ7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RTP3Q9BQQ7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RTP3Q9BQQ7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RTP3Q9BQQ7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RTP3Q9BQQ7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RTP3Q9BQQ7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RTP3Q9BQQ7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RTP3Q9BQQ7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RTP3Q9BQQ7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
RTP3Q9BQQ7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RTP3Q9BQQ7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
RTP3Q9BQQ7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RTP3Q9BQQ7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RTP3Q9BQQ7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RTP3Q9BQQ7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RTP3Q9BQQ7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RTP3Q9BQQ7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RTP3Q9BQQ7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RTP3Q9BQQ7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RTP3Q9BQQ7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RTP3Q9BQQ7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RTP3Q9BQQ7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RTP3Q9BQQ7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RTP3Q9BQQ7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RTP3Q9BQQ7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RTP3Q9BQQ7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RTP3Q9BQQ7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RTP3Q9BQQ7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RTP3Q9BQQ7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RTP3Q9BQQ7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RTP3Q9BQQ7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RTP3Q9BQQ7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms