Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQG1

SYT3, Synaptotagmin-3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT3Q9BQG1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT3Q9BQG1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT3Q9BQG1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT3Q9BQG1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT3Q9BQG1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT3Q9BQG1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYT3Q9BQG1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYT3Q9BQG1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYT3Q9BQG1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYT3Q9BQG1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYT3Q9BQG1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYT3Q9BQG1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYT3Q9BQG1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYT3Q9BQG1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYT3Q9BQG1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYT3Q9BQG1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYT3Q9BQG1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYT3Q9BQG1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYT3Q9BQG1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYT3Q9BQG1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SYT3Q9BQG1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYT3Q9BQG1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYT3Q9BQG1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYT3Q9BQG1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYT3Q9BQG1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYT3Q9BQG1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYT3Q9BQG1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYT3Q9BQG1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYT3Q9BQG1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYT3Q9BQG1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYT3Q9BQG1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYT3Q9BQG1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYT3Q9BQG1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYT3Q9BQG1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT3Q9BQG1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT3Q9BQG1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT3Q9BQG1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT3Q9BQG1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT3Q9BQG1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT3Q9BQG1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT3Q9BQG1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT3Q9BQG1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT3Q9BQG1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYT3Q9BQG1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYT3Q9BQG1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYT3Q9BQG1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SYT3Q9BQG1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYT3Q9BQG1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYT3Q9BQG1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYT3Q9BQG1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYT3Q9BQG1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYT3Q9BQG1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYT3Q9BQG1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYT3Q9BQG1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYT3Q9BQG1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYT3Q9BQG1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SYT3Q9BQG1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYT3Q9BQG1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYT3Q9BQG1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYT3Q9BQG1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYT3Q9BQG1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SYT3Q9BQG1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYT3Q9BQG1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYT3Q9BQG1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYT3Q9BQG1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYT3Q9BQG1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYT3Q9BQG1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYT3Q9BQG1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT3Q9BQG1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT3Q9BQG1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT3Q9BQG1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT3Q9BQG1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT3Q9BQG1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT3Q9BQG1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT3Q9BQG1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT3Q9BQG1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT3Q9BQG1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT3Q9BQG1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT3Q9BQG1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT3Q9BQG1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT3Q9BQG1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT3Q9BQG1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT3Q9BQG1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT3Q9BQG1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT3Q9BQG1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT3Q9BQG1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT3Q9BQG1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT3Q9BQG1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT3Q9BQG1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT3Q9BQG1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT3Q9BQG1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT3Q9BQG1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT3Q9BQG1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT3Q9BQG1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT3Q9BQG1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT3Q9BQG1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT3Q9BQG1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT3Q9BQG1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT3Q9BQG1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SYT3Q9BQG1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms