Protein–RNA interactions for Protein: Q99805

TM9SF2, Transmembrane 9 superfamily member 2, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF2Q99805 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM9SF2Q99805 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM9SF2Q99805 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM9SF2Q99805 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TM9SF2Q99805 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM9SF2Q99805 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM9SF2Q99805 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM9SF2Q99805 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM9SF2Q99805 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM9SF2Q99805 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM9SF2Q99805 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM9SF2Q99805 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM9SF2Q99805 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TM9SF2Q99805 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM9SF2Q99805 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM9SF2Q99805 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM9SF2Q99805 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM9SF2Q99805 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM9SF2Q99805 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM9SF2Q99805 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM9SF2Q99805 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM9SF2Q99805 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM9SF2Q99805 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM9SF2Q99805 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM9SF2Q99805 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM9SF2Q99805 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM9SF2Q99805 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM9SF2Q99805 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM9SF2Q99805 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TM9SF2Q99805 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TM9SF2Q99805 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TM9SF2Q99805 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TM9SF2Q99805 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TM9SF2Q99805 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TM9SF2Q99805 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TM9SF2Q99805 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TM9SF2Q99805 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TM9SF2Q99805 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TM9SF2Q99805 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TM9SF2Q99805 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TM9SF2Q99805 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TM9SF2Q99805 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TM9SF2Q99805 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TM9SF2Q99805 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TM9SF2Q99805 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TM9SF2Q99805 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TM9SF2Q99805 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TM9SF2Q99805 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TM9SF2Q99805 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TM9SF2Q99805 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TM9SF2Q99805 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TM9SF2Q99805 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TM9SF2Q99805 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TM9SF2Q99805 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TM9SF2Q99805 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TM9SF2Q99805 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TM9SF2Q99805 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TM9SF2Q99805 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TM9SF2Q99805 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TM9SF2Q99805 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TM9SF2Q99805 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TM9SF2Q99805 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TM9SF2Q99805 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TM9SF2Q99805 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TM9SF2Q99805 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TM9SF2Q99805 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM9SF2Q99805 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM9SF2Q99805 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM9SF2Q99805 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM9SF2Q99805 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM9SF2Q99805 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM9SF2Q99805 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM9SF2Q99805 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM9SF2Q99805 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM9SF2Q99805 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM9SF2Q99805 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM9SF2Q99805 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM9SF2Q99805 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM9SF2Q99805 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM9SF2Q99805 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM9SF2Q99805 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM9SF2Q99805 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM9SF2Q99805 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM9SF2Q99805 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM9SF2Q99805 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TM9SF2Q99805 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM9SF2Q99805 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TM9SF2Q99805 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TM9SF2Q99805 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TM9SF2Q99805 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TM9SF2Q99805 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TM9SF2Q99805 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TM9SF2Q99805 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TM9SF2Q99805 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TM9SF2Q99805 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TM9SF2Q99805 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TM9SF2Q99805 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TM9SF2Q99805 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TM9SF2Q99805 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TM9SF2Q99805 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms