Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SORT1Q99523 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SORT1Q99523 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SORT1Q99523 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SORT1Q99523 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SORT1Q99523 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SORT1Q99523 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SORT1Q99523 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SORT1Q99523 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SORT1Q99523 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SORT1Q99523 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SORT1Q99523 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SORT1Q99523 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SORT1Q99523 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SORT1Q99523 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SORT1Q99523 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SORT1Q99523 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SORT1Q99523 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SORT1Q99523 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SORT1Q99523 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SORT1Q99523 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SORT1Q99523 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SORT1Q99523 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SORT1Q99523 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SORT1Q99523 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SORT1Q99523 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SORT1Q99523 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SORT1Q99523 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SORT1Q99523 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SORT1Q99523 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SORT1Q99523 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SORT1Q99523 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SORT1Q99523 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SORT1Q99523 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SORT1Q99523 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SORT1Q99523 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SORT1Q99523 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SORT1Q99523 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SORT1Q99523 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SORT1Q99523 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SORT1Q99523 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SORT1Q99523 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SORT1Q99523 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SORT1Q99523 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SORT1Q99523 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SORT1Q99523 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SORT1Q99523 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SORT1Q99523 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SORT1Q99523 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SORT1Q99523 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SORT1Q99523 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SORT1Q99523 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SORT1Q99523 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SORT1Q99523 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SORT1Q99523 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SORT1Q99523 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SORT1Q99523 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SORT1Q99523 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SORT1Q99523 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SORT1Q99523 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SORT1Q99523 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SORT1Q99523 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SORT1Q99523 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SORT1Q99523 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SORT1Q99523 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SORT1Q99523 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SORT1Q99523 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SORT1Q99523 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SORT1Q99523 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SORT1Q99523 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SORT1Q99523 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SORT1Q99523 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SORT1Q99523 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SORT1Q99523 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SORT1Q99523 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SORT1Q99523 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SORT1Q99523 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SORT1Q99523 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SORT1Q99523 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SORT1Q99523 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SORT1Q99523 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SORT1Q99523 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SORT1Q99523 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SORT1Q99523 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SORT1Q99523 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SORT1Q99523 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SORT1Q99523 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SORT1Q99523 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SORT1Q99523 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SORT1Q99523 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SORT1Q99523 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SORT1Q99523 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SORT1Q99523 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SORT1Q99523 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SORT1Q99523 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SORT1Q99523 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SORT1Q99523 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SORT1Q99523 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SORT1Q99523 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SORT1Q99523 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms