Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBGCP5Q96RT8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBGCP5Q96RT8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBGCP5Q96RT8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBGCP5Q96RT8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBGCP5Q96RT8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBGCP5Q96RT8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBGCP5Q96RT8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBGCP5Q96RT8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBGCP5Q96RT8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBGCP5Q96RT8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBGCP5Q96RT8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBGCP5Q96RT8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBGCP5Q96RT8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBGCP5Q96RT8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBGCP5Q96RT8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBGCP5Q96RT8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBGCP5Q96RT8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBGCP5Q96RT8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBGCP5Q96RT8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBGCP5Q96RT8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBGCP5Q96RT8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBGCP5Q96RT8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBGCP5Q96RT8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBGCP5Q96RT8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBGCP5Q96RT8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBGCP5Q96RT8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBGCP5Q96RT8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBGCP5Q96RT8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TUBGCP5Q96RT8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TUBGCP5Q96RT8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
TUBGCP5Q96RT8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBGCP5Q96RT8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBGCP5Q96RT8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBGCP5Q96RT8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBGCP5Q96RT8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBGCP5Q96RT8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBGCP5Q96RT8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBGCP5Q96RT8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBGCP5Q96RT8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBGCP5Q96RT8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBGCP5Q96RT8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBGCP5Q96RT8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBGCP5Q96RT8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBGCP5Q96RT8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBGCP5Q96RT8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBGCP5Q96RT8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBGCP5Q96RT8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBGCP5Q96RT8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBGCP5Q96RT8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBGCP5Q96RT8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBGCP5Q96RT8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBGCP5Q96RT8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBGCP5Q96RT8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBGCP5Q96RT8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBGCP5Q96RT8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBGCP5Q96RT8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBGCP5Q96RT8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBGCP5Q96RT8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBGCP5Q96RT8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBGCP5Q96RT8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBGCP5Q96RT8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBGCP5Q96RT8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBGCP5Q96RT8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBGCP5Q96RT8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBGCP5Q96RT8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBGCP5Q96RT8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBGCP5Q96RT8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBGCP5Q96RT8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBGCP5Q96RT8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBGCP5Q96RT8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBGCP5Q96RT8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBGCP5Q96RT8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBGCP5Q96RT8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBGCP5Q96RT8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBGCP5Q96RT8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBGCP5Q96RT8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBGCP5Q96RT8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBGCP5Q96RT8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBGCP5Q96RT8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBGCP5Q96RT8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBGCP5Q96RT8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBGCP5Q96RT8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBGCP5Q96RT8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBGCP5Q96RT8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBGCP5Q96RT8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBGCP5Q96RT8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBGCP5Q96RT8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBGCP5Q96RT8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBGCP5Q96RT8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBGCP5Q96RT8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TUBGCP5Q96RT8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBGCP5Q96RT8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBGCP5Q96RT8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBGCP5Q96RT8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBGCP5Q96RT8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBGCP5Q96RT8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBGCP5Q96RT8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBGCP5Q96RT8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBGCP5Q96RT8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms