Protein–RNA interactions for Protein: Q96NI6

LRFN5, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN5Q96NI6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRFN5Q96NI6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRFN5Q96NI6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRFN5Q96NI6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRFN5Q96NI6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRFN5Q96NI6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRFN5Q96NI6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LRFN5Q96NI6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRFN5Q96NI6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRFN5Q96NI6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRFN5Q96NI6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRFN5Q96NI6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRFN5Q96NI6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRFN5Q96NI6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRFN5Q96NI6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LRFN5Q96NI6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRFN5Q96NI6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRFN5Q96NI6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRFN5Q96NI6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRFN5Q96NI6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRFN5Q96NI6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRFN5Q96NI6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRFN5Q96NI6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRFN5Q96NI6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRFN5Q96NI6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRFN5Q96NI6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRFN5Q96NI6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRFN5Q96NI6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRFN5Q96NI6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRFN5Q96NI6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LRFN5Q96NI6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LRFN5Q96NI6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRFN5Q96NI6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRFN5Q96NI6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRFN5Q96NI6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRFN5Q96NI6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRFN5Q96NI6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LRFN5Q96NI6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRFN5Q96NI6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRFN5Q96NI6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRFN5Q96NI6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRFN5Q96NI6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRFN5Q96NI6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRFN5Q96NI6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRFN5Q96NI6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRFN5Q96NI6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRFN5Q96NI6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRFN5Q96NI6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRFN5Q96NI6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRFN5Q96NI6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRFN5Q96NI6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LRFN5Q96NI6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRFN5Q96NI6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRFN5Q96NI6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRFN5Q96NI6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRFN5Q96NI6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRFN5Q96NI6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRFN5Q96NI6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRFN5Q96NI6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRFN5Q96NI6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRFN5Q96NI6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRFN5Q96NI6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRFN5Q96NI6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRFN5Q96NI6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRFN5Q96NI6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRFN5Q96NI6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRFN5Q96NI6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRFN5Q96NI6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRFN5Q96NI6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRFN5Q96NI6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRFN5Q96NI6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRFN5Q96NI6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRFN5Q96NI6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRFN5Q96NI6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRFN5Q96NI6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRFN5Q96NI6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRFN5Q96NI6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRFN5Q96NI6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRFN5Q96NI6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRFN5Q96NI6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRFN5Q96NI6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRFN5Q96NI6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRFN5Q96NI6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRFN5Q96NI6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LRFN5Q96NI6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRFN5Q96NI6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRFN5Q96NI6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LRFN5Q96NI6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRFN5Q96NI6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRFN5Q96NI6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LRFN5Q96NI6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRFN5Q96NI6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRFN5Q96NI6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRFN5Q96NI6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRFN5Q96NI6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRFN5Q96NI6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRFN5Q96NI6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LRFN5Q96NI6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRFN5Q96NI6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRFN5Q96NI6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms