Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB2

SFXN2, Sideroflexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN2Q96NB2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFXN2Q96NB2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFXN2Q96NB2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFXN2Q96NB2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFXN2Q96NB2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFXN2Q96NB2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFXN2Q96NB2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFXN2Q96NB2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFXN2Q96NB2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SFXN2Q96NB2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFXN2Q96NB2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFXN2Q96NB2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SFXN2Q96NB2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFXN2Q96NB2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFXN2Q96NB2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFXN2Q96NB2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFXN2Q96NB2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFXN2Q96NB2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFXN2Q96NB2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFXN2Q96NB2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFXN2Q96NB2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFXN2Q96NB2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFXN2Q96NB2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SFXN2Q96NB2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SFXN2Q96NB2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFXN2Q96NB2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFXN2Q96NB2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SFXN2Q96NB2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFXN2Q96NB2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFXN2Q96NB2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFXN2Q96NB2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFXN2Q96NB2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFXN2Q96NB2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFXN2Q96NB2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFXN2Q96NB2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFXN2Q96NB2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFXN2Q96NB2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SFXN2Q96NB2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SFXN2Q96NB2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFXN2Q96NB2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFXN2Q96NB2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFXN2Q96NB2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFXN2Q96NB2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFXN2Q96NB2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFXN2Q96NB2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFXN2Q96NB2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SFXN2Q96NB2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFXN2Q96NB2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFXN2Q96NB2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFXN2Q96NB2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFXN2Q96NB2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFXN2Q96NB2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFXN2Q96NB2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFXN2Q96NB2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFXN2Q96NB2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFXN2Q96NB2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFXN2Q96NB2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFXN2Q96NB2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFXN2Q96NB2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFXN2Q96NB2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFXN2Q96NB2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFXN2Q96NB2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SFXN2Q96NB2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFXN2Q96NB2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFXN2Q96NB2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SFXN2Q96NB2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SFXN2Q96NB2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SFXN2Q96NB2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFXN2Q96NB2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFXN2Q96NB2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFXN2Q96NB2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFXN2Q96NB2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFXN2Q96NB2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFXN2Q96NB2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFXN2Q96NB2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFXN2Q96NB2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFXN2Q96NB2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFXN2Q96NB2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFXN2Q96NB2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SFXN2Q96NB2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SFXN2Q96NB2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SFXN2Q96NB2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFXN2Q96NB2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFXN2Q96NB2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFXN2Q96NB2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFXN2Q96NB2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFXN2Q96NB2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFXN2Q96NB2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFXN2Q96NB2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFXN2Q96NB2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFXN2Q96NB2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SFXN2Q96NB2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFXN2Q96NB2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFXN2Q96NB2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFXN2Q96NB2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFXN2Q96NB2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFXN2Q96NB2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFXN2Q96NB2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFXN2Q96NB2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFXN2Q96NB2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.3 ms