Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR6

CFAP57, Cilia- and flagella-associated protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP57Q96MR6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CFAP57Q96MR6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CFAP57Q96MR6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP57Q96MR6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP57Q96MR6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP57Q96MR6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP57Q96MR6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP57Q96MR6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP57Q96MR6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP57Q96MR6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP57Q96MR6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP57Q96MR6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP57Q96MR6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP57Q96MR6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP57Q96MR6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP57Q96MR6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP57Q96MR6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP57Q96MR6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP57Q96MR6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP57Q96MR6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP57Q96MR6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP57Q96MR6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP57Q96MR6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP57Q96MR6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP57Q96MR6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP57Q96MR6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP57Q96MR6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP57Q96MR6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP57Q96MR6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP57Q96MR6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP57Q96MR6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP57Q96MR6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFAP57Q96MR6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFAP57Q96MR6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFAP57Q96MR6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP57Q96MR6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP57Q96MR6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP57Q96MR6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP57Q96MR6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP57Q96MR6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFAP57Q96MR6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFAP57Q96MR6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFAP57Q96MR6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFAP57Q96MR6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFAP57Q96MR6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFAP57Q96MR6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFAP57Q96MR6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFAP57Q96MR6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFAP57Q96MR6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFAP57Q96MR6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFAP57Q96MR6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFAP57Q96MR6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFAP57Q96MR6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFAP57Q96MR6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFAP57Q96MR6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFAP57Q96MR6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CFAP57Q96MR6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CFAP57Q96MR6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CFAP57Q96MR6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CFAP57Q96MR6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CFAP57Q96MR6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CFAP57Q96MR6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CFAP57Q96MR6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CFAP57Q96MR6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CFAP57Q96MR6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFAP57Q96MR6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFAP57Q96MR6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFAP57Q96MR6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFAP57Q96MR6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFAP57Q96MR6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFAP57Q96MR6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFAP57Q96MR6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFAP57Q96MR6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP57Q96MR6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP57Q96MR6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP57Q96MR6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP57Q96MR6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP57Q96MR6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP57Q96MR6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP57Q96MR6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP57Q96MR6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP57Q96MR6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP57Q96MR6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFAP57Q96MR6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFAP57Q96MR6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFAP57Q96MR6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CFAP57Q96MR6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFAP57Q96MR6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP57Q96MR6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP57Q96MR6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP57Q96MR6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP57Q96MR6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CFAP57Q96MR6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFAP57Q96MR6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFAP57Q96MR6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFAP57Q96MR6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFAP57Q96MR6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFAP57Q96MR6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFAP57Q96MR6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFAP57Q96MR6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms