Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ZNF488Q96MN9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF488Q96MN9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF488Q96MN9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ZNF488Q96MN9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF488Q96MN9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF488Q96MN9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF488Q96MN9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF488Q96MN9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF488Q96MN9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF488Q96MN9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF488Q96MN9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF488Q96MN9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF488Q96MN9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF488Q96MN9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF488Q96MN9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF488Q96MN9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF488Q96MN9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF488Q96MN9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF488Q96MN9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF488Q96MN9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF488Q96MN9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF488Q96MN9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF488Q96MN9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF488Q96MN9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF488Q96MN9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF488Q96MN9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF488Q96MN9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF488Q96MN9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF488Q96MN9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF488Q96MN9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF488Q96MN9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF488Q96MN9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF488Q96MN9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF488Q96MN9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF488Q96MN9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF488Q96MN9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF488Q96MN9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF488Q96MN9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF488Q96MN9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF488Q96MN9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF488Q96MN9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF488Q96MN9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF488Q96MN9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF488Q96MN9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF488Q96MN9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF488Q96MN9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF488Q96MN9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF488Q96MN9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF488Q96MN9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF488Q96MN9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF488Q96MN9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF488Q96MN9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF488Q96MN9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF488Q96MN9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF488Q96MN9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF488Q96MN9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF488Q96MN9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF488Q96MN9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF488Q96MN9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF488Q96MN9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF488Q96MN9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF488Q96MN9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF488Q96MN9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZNF488Q96MN9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZNF488Q96MN9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZNF488Q96MN9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF488Q96MN9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF488Q96MN9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF488Q96MN9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF488Q96MN9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF488Q96MN9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF488Q96MN9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF488Q96MN9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF488Q96MN9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF488Q96MN9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF488Q96MN9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF488Q96MN9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF488Q96MN9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF488Q96MN9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF488Q96MN9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF488Q96MN9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF488Q96MN9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF488Q96MN9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF488Q96MN9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF488Q96MN9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF488Q96MN9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF488Q96MN9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF488Q96MN9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF488Q96MN9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF488Q96MN9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF488Q96MN9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF488Q96MN9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF488Q96MN9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF488Q96MN9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF488Q96MN9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF488Q96MN9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF488Q96MN9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF488Q96MN9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF488Q96MN9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms