Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAX2Q96IS3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAX2Q96IS3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAX2Q96IS3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAX2Q96IS3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAX2Q96IS3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAX2Q96IS3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAX2Q96IS3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAX2Q96IS3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAX2Q96IS3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RAX2Q96IS3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAX2Q96IS3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAX2Q96IS3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAX2Q96IS3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAX2Q96IS3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAX2Q96IS3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAX2Q96IS3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAX2Q96IS3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAX2Q96IS3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAX2Q96IS3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAX2Q96IS3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAX2Q96IS3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAX2Q96IS3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAX2Q96IS3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RAX2Q96IS3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAX2Q96IS3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAX2Q96IS3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAX2Q96IS3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RAX2Q96IS3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAX2Q96IS3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAX2Q96IS3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAX2Q96IS3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAX2Q96IS3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAX2Q96IS3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAX2Q96IS3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAX2Q96IS3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAX2Q96IS3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAX2Q96IS3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAX2Q96IS3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAX2Q96IS3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAX2Q96IS3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAX2Q96IS3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAX2Q96IS3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAX2Q96IS3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAX2Q96IS3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAX2Q96IS3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAX2Q96IS3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAX2Q96IS3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAX2Q96IS3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAX2Q96IS3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RAX2Q96IS3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAX2Q96IS3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAX2Q96IS3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAX2Q96IS3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAX2Q96IS3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAX2Q96IS3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAX2Q96IS3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAX2Q96IS3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RAX2Q96IS3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAX2Q96IS3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAX2Q96IS3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAX2Q96IS3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAX2Q96IS3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAX2Q96IS3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAX2Q96IS3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAX2Q96IS3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAX2Q96IS3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RAX2Q96IS3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RAX2Q96IS3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAX2Q96IS3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAX2Q96IS3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAX2Q96IS3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAX2Q96IS3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAX2Q96IS3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAX2Q96IS3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RAX2Q96IS3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAX2Q96IS3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAX2Q96IS3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAX2Q96IS3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAX2Q96IS3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAX2Q96IS3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAX2Q96IS3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RAX2Q96IS3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RAX2Q96IS3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAX2Q96IS3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAX2Q96IS3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAX2Q96IS3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAX2Q96IS3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAX2Q96IS3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAX2Q96IS3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAX2Q96IS3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAX2Q96IS3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAX2Q96IS3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAX2Q96IS3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAX2Q96IS3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAX2Q96IS3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAX2Q96IS3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RAX2Q96IS3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAX2Q96IS3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAX2Q96IS3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms