Protein–RNA interactions for Protein: Q96H20

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNF8Q96H20 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNF8Q96H20 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNF8Q96H20 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNF8Q96H20 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SNF8Q96H20 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNF8Q96H20 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNF8Q96H20 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNF8Q96H20 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNF8Q96H20 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNF8Q96H20 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNF8Q96H20 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNF8Q96H20 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNF8Q96H20 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNF8Q96H20 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNF8Q96H20 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNF8Q96H20 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNF8Q96H20 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNF8Q96H20 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNF8Q96H20 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNF8Q96H20 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNF8Q96H20 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNF8Q96H20 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNF8Q96H20 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNF8Q96H20 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SNF8Q96H20 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNF8Q96H20 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNF8Q96H20 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNF8Q96H20 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNF8Q96H20 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNF8Q96H20 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNF8Q96H20 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNF8Q96H20 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNF8Q96H20 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNF8Q96H20 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNF8Q96H20 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNF8Q96H20 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNF8Q96H20 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNF8Q96H20 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNF8Q96H20 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNF8Q96H20 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNF8Q96H20 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNF8Q96H20 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNF8Q96H20 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNF8Q96H20 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SNF8Q96H20 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNF8Q96H20 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNF8Q96H20 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNF8Q96H20 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNF8Q96H20 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNF8Q96H20 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNF8Q96H20 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNF8Q96H20 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNF8Q96H20 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNF8Q96H20 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNF8Q96H20 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNF8Q96H20 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNF8Q96H20 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNF8Q96H20 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNF8Q96H20 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNF8Q96H20 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNF8Q96H20 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNF8Q96H20 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNF8Q96H20 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNF8Q96H20 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNF8Q96H20 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNF8Q96H20 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNF8Q96H20 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNF8Q96H20 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNF8Q96H20 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNF8Q96H20 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNF8Q96H20 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNF8Q96H20 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNF8Q96H20 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNF8Q96H20 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNF8Q96H20 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SNF8Q96H20 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNF8Q96H20 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNF8Q96H20 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNF8Q96H20 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNF8Q96H20 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNF8Q96H20 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNF8Q96H20 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNF8Q96H20 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNF8Q96H20 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNF8Q96H20 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNF8Q96H20 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNF8Q96H20 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNF8Q96H20 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNF8Q96H20 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SNF8Q96H20 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SNF8Q96H20 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNF8Q96H20 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNF8Q96H20 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNF8Q96H20 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNF8Q96H20 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNF8Q96H20 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNF8Q96H20 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNF8Q96H20 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNF8Q96H20 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNF8Q96H20 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms