Protein–RNA interactions for Protein: Q96FS4

SIPA1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1Q96FS4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIPA1Q96FS4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SIPA1Q96FS4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIPA1Q96FS4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SIPA1Q96FS4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIPA1Q96FS4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SIPA1Q96FS4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SIPA1Q96FS4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIPA1Q96FS4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIPA1Q96FS4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIPA1Q96FS4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIPA1Q96FS4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIPA1Q96FS4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIPA1Q96FS4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIPA1Q96FS4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIPA1Q96FS4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIPA1Q96FS4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIPA1Q96FS4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIPA1Q96FS4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIPA1Q96FS4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SIPA1Q96FS4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIPA1Q96FS4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIPA1Q96FS4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIPA1Q96FS4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIPA1Q96FS4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIPA1Q96FS4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIPA1Q96FS4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIPA1Q96FS4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIPA1Q96FS4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIPA1Q96FS4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIPA1Q96FS4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIPA1Q96FS4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SIPA1Q96FS4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIPA1Q96FS4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIPA1Q96FS4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIPA1Q96FS4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIPA1Q96FS4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIPA1Q96FS4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIPA1Q96FS4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIPA1Q96FS4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIPA1Q96FS4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIPA1Q96FS4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIPA1Q96FS4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIPA1Q96FS4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIPA1Q96FS4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIPA1Q96FS4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIPA1Q96FS4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIPA1Q96FS4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIPA1Q96FS4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIPA1Q96FS4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIPA1Q96FS4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIPA1Q96FS4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIPA1Q96FS4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIPA1Q96FS4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIPA1Q96FS4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIPA1Q96FS4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIPA1Q96FS4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIPA1Q96FS4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIPA1Q96FS4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SIPA1Q96FS4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIPA1Q96FS4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SIPA1Q96FS4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SIPA1Q96FS4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIPA1Q96FS4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIPA1Q96FS4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIPA1Q96FS4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SIPA1Q96FS4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIPA1Q96FS4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIPA1Q96FS4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIPA1Q96FS4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIPA1Q96FS4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIPA1Q96FS4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIPA1Q96FS4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIPA1Q96FS4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIPA1Q96FS4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIPA1Q96FS4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIPA1Q96FS4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIPA1Q96FS4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIPA1Q96FS4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SIPA1Q96FS4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIPA1Q96FS4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIPA1Q96FS4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIPA1Q96FS4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIPA1Q96FS4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIPA1Q96FS4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SIPA1Q96FS4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIPA1Q96FS4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIPA1Q96FS4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIPA1Q96FS4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIPA1Q96FS4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIPA1Q96FS4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIPA1Q96FS4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIPA1Q96FS4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIPA1Q96FS4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SIPA1Q96FS4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SIPA1Q96FS4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIPA1Q96FS4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIPA1Q96FS4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIPA1Q96FS4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SIPA1Q96FS4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms