Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DDX11Q96FC9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DDX11Q96FC9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DDX11Q96FC9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DDX11Q96FC9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DDX11Q96FC9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DDX11Q96FC9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DDX11Q96FC9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DDX11Q96FC9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DDX11Q96FC9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDX11Q96FC9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDX11Q96FC9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDX11Q96FC9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDX11Q96FC9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
DDX11Q96FC9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DDX11Q96FC9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
DDX11Q96FC9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
DDX11Q96FC9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
DDX11Q96FC9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DDX11Q96FC9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDX11Q96FC9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDX11Q96FC9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDX11Q96FC9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDX11Q96FC9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDX11Q96FC9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.28
DDX11Q96FC9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DDX11Q96FC9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DDX11Q96FC9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
DDX11Q96FC9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DDX11Q96FC9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDX11Q96FC9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDX11Q96FC9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDX11Q96FC9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDX11Q96FC9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDX11Q96FC9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDX11Q96FC9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDX11Q96FC9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDX11Q96FC9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDX11Q96FC9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDX11Q96FC9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDX11Q96FC9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDX11Q96FC9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDX11Q96FC9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDX11Q96FC9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDX11Q96FC9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDX11Q96FC9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
DDX11Q96FC9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDX11Q96FC9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
DDX11Q96FC9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DDX11Q96FC9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DDX11Q96FC9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DDX11Q96FC9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDX11Q96FC9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDX11Q96FC9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDX11Q96FC9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDX11Q96FC9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDX11Q96FC9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDX11Q96FC9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDX11Q96FC9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDX11Q96FC9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDX11Q96FC9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDX11Q96FC9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDX11Q96FC9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDX11Q96FC9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
DDX11Q96FC9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX11Q96FC9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX11Q96FC9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
DDX11Q96FC9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DDX11Q96FC9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DDX11Q96FC9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDX11Q96FC9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDX11Q96FC9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDX11Q96FC9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
DDX11Q96FC9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDX11Q96FC9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDX11Q96FC9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDX11Q96FC9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDX11Q96FC9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDX11Q96FC9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDX11Q96FC9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDX11Q96FC9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDX11Q96FC9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDX11Q96FC9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDX11Q96FC9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDX11Q96FC9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDX11Q96FC9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDX11Q96FC9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDX11Q96FC9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDX11Q96FC9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDX11Q96FC9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDX11Q96FC9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDX11Q96FC9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDX11Q96FC9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDX11Q96FC9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDX11Q96FC9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX11Q96FC9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX11Q96FC9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDX11Q96FC9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDX11Q96FC9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDX11Q96FC9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms