Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAJA3Q96EY1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAJA3Q96EY1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAJA3Q96EY1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAJA3Q96EY1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAJA3Q96EY1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAJA3Q96EY1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAJA3Q96EY1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAJA3Q96EY1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAJA3Q96EY1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAJA3Q96EY1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAJA3Q96EY1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAJA3Q96EY1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAJA3Q96EY1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAJA3Q96EY1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAJA3Q96EY1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJA3Q96EY1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJA3Q96EY1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJA3Q96EY1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJA3Q96EY1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJA3Q96EY1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJA3Q96EY1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJA3Q96EY1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJA3Q96EY1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJA3Q96EY1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJA3Q96EY1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJA3Q96EY1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJA3Q96EY1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJA3Q96EY1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJA3Q96EY1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJA3Q96EY1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJA3Q96EY1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJA3Q96EY1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJA3Q96EY1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJA3Q96EY1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNAJA3Q96EY1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNAJA3Q96EY1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNAJA3Q96EY1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAJA3Q96EY1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAJA3Q96EY1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAJA3Q96EY1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAJA3Q96EY1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAJA3Q96EY1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAJA3Q96EY1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJA3Q96EY1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJA3Q96EY1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJA3Q96EY1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJA3Q96EY1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJA3Q96EY1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJA3Q96EY1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJA3Q96EY1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJA3Q96EY1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJA3Q96EY1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJA3Q96EY1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJA3Q96EY1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJA3Q96EY1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJA3Q96EY1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJA3Q96EY1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJA3Q96EY1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJA3Q96EY1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJA3Q96EY1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJA3Q96EY1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJA3Q96EY1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJA3Q96EY1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJA3Q96EY1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJA3Q96EY1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAJA3Q96EY1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAJA3Q96EY1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAJA3Q96EY1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAJA3Q96EY1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJA3Q96EY1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJA3Q96EY1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJA3Q96EY1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJA3Q96EY1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJA3Q96EY1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJA3Q96EY1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJA3Q96EY1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJA3Q96EY1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJA3Q96EY1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJA3Q96EY1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJA3Q96EY1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJA3Q96EY1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAJA3Q96EY1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAJA3Q96EY1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAJA3Q96EY1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAJA3Q96EY1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAJA3Q96EY1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAJA3Q96EY1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAJA3Q96EY1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAJA3Q96EY1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAJA3Q96EY1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJA3Q96EY1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJA3Q96EY1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJA3Q96EY1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJA3Q96EY1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJA3Q96EY1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJA3Q96EY1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJA3Q96EY1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJA3Q96EY1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJA3Q96EY1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms