Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ELP4Q96EB1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ELP4Q96EB1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ELP4Q96EB1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ELP4Q96EB1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ELP4Q96EB1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ELP4Q96EB1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ELP4Q96EB1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ELP4Q96EB1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ELP4Q96EB1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ELP4Q96EB1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ELP4Q96EB1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ELP4Q96EB1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ELP4Q96EB1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ELP4Q96EB1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ELP4Q96EB1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ELP4Q96EB1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ELP4Q96EB1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ELP4Q96EB1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ELP4Q96EB1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ELP4Q96EB1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ELP4Q96EB1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ELP4Q96EB1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ELP4Q96EB1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ELP4Q96EB1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ELP4Q96EB1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ELP4Q96EB1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ELP4Q96EB1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ELP4Q96EB1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ELP4Q96EB1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ELP4Q96EB1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ELP4Q96EB1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ELP4Q96EB1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELP4Q96EB1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELP4Q96EB1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELP4Q96EB1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELP4Q96EB1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELP4Q96EB1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELP4Q96EB1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ELP4Q96EB1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELP4Q96EB1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELP4Q96EB1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELP4Q96EB1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELP4Q96EB1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELP4Q96EB1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELP4Q96EB1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELP4Q96EB1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELP4Q96EB1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELP4Q96EB1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELP4Q96EB1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELP4Q96EB1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELP4Q96EB1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELP4Q96EB1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELP4Q96EB1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELP4Q96EB1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELP4Q96EB1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELP4Q96EB1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELP4Q96EB1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELP4Q96EB1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELP4Q96EB1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELP4Q96EB1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELP4Q96EB1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELP4Q96EB1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELP4Q96EB1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELP4Q96EB1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ELP4Q96EB1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ELP4Q96EB1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ELP4Q96EB1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELP4Q96EB1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELP4Q96EB1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELP4Q96EB1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ELP4Q96EB1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELP4Q96EB1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELP4Q96EB1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELP4Q96EB1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ELP4Q96EB1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELP4Q96EB1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELP4Q96EB1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELP4Q96EB1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELP4Q96EB1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELP4Q96EB1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELP4Q96EB1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELP4Q96EB1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELP4Q96EB1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELP4Q96EB1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELP4Q96EB1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELP4Q96EB1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELP4Q96EB1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELP4Q96EB1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELP4Q96EB1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ELP4Q96EB1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ELP4Q96EB1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ELP4Q96EB1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ELP4Q96EB1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ELP4Q96EB1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ELP4Q96EB1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ELP4Q96EB1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ELP4Q96EB1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ELP4Q96EB1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ELP4Q96EB1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms