Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NXPE2Q96DL1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NXPE2Q96DL1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NXPE2Q96DL1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NXPE2Q96DL1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NXPE2Q96DL1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NXPE2Q96DL1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NXPE2Q96DL1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NXPE2Q96DL1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NXPE2Q96DL1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NXPE2Q96DL1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NXPE2Q96DL1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NXPE2Q96DL1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NXPE2Q96DL1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NXPE2Q96DL1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NXPE2Q96DL1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NXPE2Q96DL1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NXPE2Q96DL1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NXPE2Q96DL1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NXPE2Q96DL1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NXPE2Q96DL1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NXPE2Q96DL1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NXPE2Q96DL1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NXPE2Q96DL1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NXPE2Q96DL1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NXPE2Q96DL1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NXPE2Q96DL1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NXPE2Q96DL1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NXPE2Q96DL1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NXPE2Q96DL1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NXPE2Q96DL1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NXPE2Q96DL1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NXPE2Q96DL1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NXPE2Q96DL1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NXPE2Q96DL1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NXPE2Q96DL1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NXPE2Q96DL1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NXPE2Q96DL1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NXPE2Q96DL1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NXPE2Q96DL1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NXPE2Q96DL1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NXPE2Q96DL1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NXPE2Q96DL1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NXPE2Q96DL1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NXPE2Q96DL1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NXPE2Q96DL1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NXPE2Q96DL1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NXPE2Q96DL1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NXPE2Q96DL1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NXPE2Q96DL1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NXPE2Q96DL1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NXPE2Q96DL1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NXPE2Q96DL1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NXPE2Q96DL1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NXPE2Q96DL1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NXPE2Q96DL1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NXPE2Q96DL1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NXPE2Q96DL1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NXPE2Q96DL1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NXPE2Q96DL1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NXPE2Q96DL1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NXPE2Q96DL1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NXPE2Q96DL1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NXPE2Q96DL1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NXPE2Q96DL1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NXPE2Q96DL1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NXPE2Q96DL1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NXPE2Q96DL1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NXPE2Q96DL1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NXPE2Q96DL1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NXPE2Q96DL1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NXPE2Q96DL1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NXPE2Q96DL1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NXPE2Q96DL1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NXPE2Q96DL1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NXPE2Q96DL1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NXPE2Q96DL1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NXPE2Q96DL1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NXPE2Q96DL1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NXPE2Q96DL1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NXPE2Q96DL1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NXPE2Q96DL1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NXPE2Q96DL1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NXPE2Q96DL1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NXPE2Q96DL1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NXPE2Q96DL1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NXPE2Q96DL1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NXPE2Q96DL1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NXPE2Q96DL1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NXPE2Q96DL1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NXPE2Q96DL1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NXPE2Q96DL1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NXPE2Q96DL1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NXPE2Q96DL1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NXPE2Q96DL1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NXPE2Q96DL1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NXPE2Q96DL1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NXPE2Q96DL1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NXPE2Q96DL1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NXPE2Q96DL1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms