Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
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