Protein–RNA interactions for Protein: Q96C92

SDCCAG3, Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3Q96C92 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDCCAG3Q96C92 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDCCAG3Q96C92 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDCCAG3Q96C92 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDCCAG3Q96C92 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDCCAG3Q96C92 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDCCAG3Q96C92 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDCCAG3Q96C92 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDCCAG3Q96C92 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDCCAG3Q96C92 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDCCAG3Q96C92 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDCCAG3Q96C92 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDCCAG3Q96C92 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDCCAG3Q96C92 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDCCAG3Q96C92 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDCCAG3Q96C92 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDCCAG3Q96C92 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDCCAG3Q96C92 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDCCAG3Q96C92 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SDCCAG3Q96C92 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDCCAG3Q96C92 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDCCAG3Q96C92 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDCCAG3Q96C92 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDCCAG3Q96C92 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDCCAG3Q96C92 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDCCAG3Q96C92 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDCCAG3Q96C92 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDCCAG3Q96C92 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDCCAG3Q96C92 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDCCAG3Q96C92 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDCCAG3Q96C92 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDCCAG3Q96C92 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDCCAG3Q96C92 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDCCAG3Q96C92 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDCCAG3Q96C92 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SDCCAG3Q96C92 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDCCAG3Q96C92 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDCCAG3Q96C92 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDCCAG3Q96C92 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SDCCAG3Q96C92 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SDCCAG3Q96C92 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDCCAG3Q96C92 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDCCAG3Q96C92 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDCCAG3Q96C92 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDCCAG3Q96C92 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDCCAG3Q96C92 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDCCAG3Q96C92 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDCCAG3Q96C92 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SDCCAG3Q96C92 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDCCAG3Q96C92 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDCCAG3Q96C92 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDCCAG3Q96C92 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDCCAG3Q96C92 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDCCAG3Q96C92 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDCCAG3Q96C92 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDCCAG3Q96C92 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDCCAG3Q96C92 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDCCAG3Q96C92 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDCCAG3Q96C92 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDCCAG3Q96C92 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDCCAG3Q96C92 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDCCAG3Q96C92 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDCCAG3Q96C92 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDCCAG3Q96C92 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDCCAG3Q96C92 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SDCCAG3Q96C92 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SDCCAG3Q96C92 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SDCCAG3Q96C92 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SDCCAG3Q96C92 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SDCCAG3Q96C92 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SDCCAG3Q96C92 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SDCCAG3Q96C92 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SDCCAG3Q96C92 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SDCCAG3Q96C92 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDCCAG3Q96C92 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDCCAG3Q96C92 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SDCCAG3Q96C92 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SDCCAG3Q96C92 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SDCCAG3Q96C92 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SDCCAG3Q96C92 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SDCCAG3Q96C92 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SDCCAG3Q96C92 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SDCCAG3Q96C92 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDCCAG3Q96C92 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDCCAG3Q96C92 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDCCAG3Q96C92 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDCCAG3Q96C92 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDCCAG3Q96C92 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDCCAG3Q96C92 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDCCAG3Q96C92 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDCCAG3Q96C92 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDCCAG3Q96C92 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDCCAG3Q96C92 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDCCAG3Q96C92 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDCCAG3Q96C92 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDCCAG3Q96C92 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDCCAG3Q96C92 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDCCAG3Q96C92 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDCCAG3Q96C92 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDCCAG3Q96C92 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms