Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFHD2Q96C19 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFHD2Q96C19 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFHD2Q96C19 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFHD2Q96C19 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFHD2Q96C19 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFHD2Q96C19 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFHD2Q96C19 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFHD2Q96C19 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFHD2Q96C19 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFHD2Q96C19 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EFHD2Q96C19 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFHD2Q96C19 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFHD2Q96C19 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFHD2Q96C19 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFHD2Q96C19 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFHD2Q96C19 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFHD2Q96C19 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFHD2Q96C19 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EFHD2Q96C19 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFHD2Q96C19 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFHD2Q96C19 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFHD2Q96C19 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFHD2Q96C19 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFHD2Q96C19 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFHD2Q96C19 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFHD2Q96C19 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFHD2Q96C19 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFHD2Q96C19 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFHD2Q96C19 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFHD2Q96C19 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFHD2Q96C19 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
EFHD2Q96C19 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFHD2Q96C19 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFHD2Q96C19 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFHD2Q96C19 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFHD2Q96C19 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFHD2Q96C19 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFHD2Q96C19 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFHD2Q96C19 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFHD2Q96C19 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFHD2Q96C19 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFHD2Q96C19 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFHD2Q96C19 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFHD2Q96C19 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFHD2Q96C19 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFHD2Q96C19 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFHD2Q96C19 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFHD2Q96C19 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFHD2Q96C19 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFHD2Q96C19 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFHD2Q96C19 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFHD2Q96C19 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFHD2Q96C19 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFHD2Q96C19 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFHD2Q96C19 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFHD2Q96C19 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFHD2Q96C19 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFHD2Q96C19 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFHD2Q96C19 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFHD2Q96C19 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFHD2Q96C19 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFHD2Q96C19 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFHD2Q96C19 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFHD2Q96C19 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFHD2Q96C19 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFHD2Q96C19 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFHD2Q96C19 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFHD2Q96C19 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
EFHD2Q96C19 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFHD2Q96C19 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFHD2Q96C19 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFHD2Q96C19 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFHD2Q96C19 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFHD2Q96C19 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFHD2Q96C19 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFHD2Q96C19 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFHD2Q96C19 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFHD2Q96C19 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EFHD2Q96C19 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EFHD2Q96C19 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EFHD2Q96C19 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFHD2Q96C19 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFHD2Q96C19 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFHD2Q96C19 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFHD2Q96C19 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFHD2Q96C19 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFHD2Q96C19 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFHD2Q96C19 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFHD2Q96C19 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFHD2Q96C19 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFHD2Q96C19 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFHD2Q96C19 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFHD2Q96C19 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFHD2Q96C19 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EFHD2Q96C19 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFHD2Q96C19 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFHD2Q96C19 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFHD2Q96C19 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFHD2Q96C19 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms