Protein–RNA interactions for Protein: Q969Y0

NXPE3, NXPE family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE3Q969Y0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NXPE3Q969Y0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NXPE3Q969Y0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NXPE3Q969Y0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NXPE3Q969Y0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NXPE3Q969Y0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NXPE3Q969Y0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NXPE3Q969Y0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NXPE3Q969Y0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NXPE3Q969Y0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NXPE3Q969Y0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NXPE3Q969Y0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NXPE3Q969Y0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NXPE3Q969Y0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NXPE3Q969Y0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NXPE3Q969Y0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NXPE3Q969Y0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NXPE3Q969Y0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NXPE3Q969Y0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NXPE3Q969Y0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NXPE3Q969Y0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NXPE3Q969Y0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NXPE3Q969Y0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NXPE3Q969Y0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NXPE3Q969Y0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NXPE3Q969Y0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NXPE3Q969Y0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NXPE3Q969Y0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NXPE3Q969Y0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NXPE3Q969Y0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NXPE3Q969Y0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NXPE3Q969Y0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NXPE3Q969Y0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NXPE3Q969Y0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NXPE3Q969Y0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NXPE3Q969Y0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NXPE3Q969Y0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NXPE3Q969Y0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NXPE3Q969Y0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NXPE3Q969Y0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NXPE3Q969Y0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NXPE3Q969Y0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NXPE3Q969Y0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NXPE3Q969Y0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NXPE3Q969Y0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NXPE3Q969Y0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NXPE3Q969Y0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NXPE3Q969Y0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NXPE3Q969Y0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NXPE3Q969Y0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NXPE3Q969Y0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NXPE3Q969Y0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NXPE3Q969Y0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NXPE3Q969Y0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NXPE3Q969Y0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NXPE3Q969Y0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NXPE3Q969Y0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NXPE3Q969Y0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NXPE3Q969Y0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NXPE3Q969Y0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NXPE3Q969Y0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NXPE3Q969Y0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NXPE3Q969Y0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NXPE3Q969Y0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NXPE3Q969Y0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NXPE3Q969Y0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NXPE3Q969Y0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NXPE3Q969Y0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NXPE3Q969Y0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NXPE3Q969Y0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NXPE3Q969Y0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NXPE3Q969Y0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NXPE3Q969Y0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NXPE3Q969Y0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NXPE3Q969Y0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NXPE3Q969Y0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NXPE3Q969Y0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NXPE3Q969Y0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NXPE3Q969Y0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NXPE3Q969Y0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NXPE3Q969Y0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NXPE3Q969Y0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NXPE3Q969Y0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NXPE3Q969Y0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NXPE3Q969Y0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NXPE3Q969Y0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NXPE3Q969Y0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NXPE3Q969Y0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NXPE3Q969Y0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NXPE3Q969Y0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NXPE3Q969Y0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NXPE3Q969Y0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NXPE3Q969Y0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NXPE3Q969Y0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NXPE3Q969Y0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NXPE3Q969Y0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NXPE3Q969Y0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NXPE3Q969Y0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NXPE3Q969Y0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NXPE3Q969Y0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms