Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BHMTQ93088 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BHMTQ93088 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BHMTQ93088 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BHMTQ93088 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BHMTQ93088 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
BHMTQ93088 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BHMTQ93088 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BHMTQ93088 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
BHMTQ93088 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BHMTQ93088 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BHMTQ93088 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BHMTQ93088 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BHMTQ93088 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BHMTQ93088 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BHMTQ93088 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BHMTQ93088 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BHMTQ93088 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BHMTQ93088 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
BHMTQ93088 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
BHMTQ93088 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BHMTQ93088 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BHMTQ93088 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BHMTQ93088 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BHMTQ93088 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BHMTQ93088 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BHMTQ93088 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BHMTQ93088 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BHMTQ93088 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BHMTQ93088 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BHMTQ93088 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BHMTQ93088 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BHMTQ93088 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BHMTQ93088 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BHMTQ93088 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BHMTQ93088 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BHMTQ93088 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
BHMTQ93088 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BHMTQ93088 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
BHMTQ93088 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BHMTQ93088 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BHMTQ93088 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BHMTQ93088 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BHMTQ93088 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BHMTQ93088 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BHMTQ93088 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BHMTQ93088 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
BHMTQ93088 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BHMTQ93088 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BHMTQ93088 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BHMTQ93088 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BHMTQ93088 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BHMTQ93088 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BHMTQ93088 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BHMTQ93088 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BHMTQ93088 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BHMTQ93088 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BHMTQ93088 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BHMTQ93088 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BHMTQ93088 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BHMTQ93088 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BHMTQ93088 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BHMTQ93088 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BHMTQ93088 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BHMTQ93088 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BHMTQ93088 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BHMTQ93088 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BHMTQ93088 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
BHMTQ93088 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BHMTQ93088 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BHMTQ93088 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BHMTQ93088 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
BHMTQ93088 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BHMTQ93088 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BHMTQ93088 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BHMTQ93088 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BHMTQ93088 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BHMTQ93088 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BHMTQ93088 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BHMTQ93088 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BHMTQ93088 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
BHMTQ93088 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BHMTQ93088 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BHMTQ93088 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BHMTQ93088 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BHMTQ93088 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BHMTQ93088 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BHMTQ93088 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BHMTQ93088 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BHMTQ93088 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BHMTQ93088 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BHMTQ93088 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BHMTQ93088 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BHMTQ93088 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BHMTQ93088 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
BHMTQ93088 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BHMTQ93088 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BHMTQ93088 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BHMTQ93088 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BHMTQ93088 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms