Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC9Q92623 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC9Q92623 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC9Q92623 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC9Q92623 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC9Q92623 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC9Q92623 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC9Q92623 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC9Q92623 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC9Q92623 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC9Q92623 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC9Q92623 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC9Q92623 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC9Q92623 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC9Q92623 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC9Q92623 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC9Q92623 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC9Q92623 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC9Q92623 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC9Q92623 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC9Q92623 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC9Q92623 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC9Q92623 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC9Q92623 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC9Q92623 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC9Q92623 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC9Q92623 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC9Q92623 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC9Q92623 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC9Q92623 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC9Q92623 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC9Q92623 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC9Q92623 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC9Q92623 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC9Q92623 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC9Q92623 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC9Q92623 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC9Q92623 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC9Q92623 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC9Q92623 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC9Q92623 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC9Q92623 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC9Q92623 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC9Q92623 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC9Q92623 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC9Q92623 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC9Q92623 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC9Q92623 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC9Q92623 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC9Q92623 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC9Q92623 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC9Q92623 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC9Q92623 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC9Q92623 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC9Q92623 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC9Q92623 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC9Q92623 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC9Q92623 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC9Q92623 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC9Q92623 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC9Q92623 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC9Q92623 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC9Q92623 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC9Q92623 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC9Q92623 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC9Q92623 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC9Q92623 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC9Q92623 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC9Q92623 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC9Q92623 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC9Q92623 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC9Q92623 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC9Q92623 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC9Q92623 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC9Q92623 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC9Q92623 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC9Q92623 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC9Q92623 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC9Q92623 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC9Q92623 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC9Q92623 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC9Q92623 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC9Q92623 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC9Q92623 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC9Q92623 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC9Q92623 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC9Q92623 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC9Q92623 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC9Q92623 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC9Q92623 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC9Q92623 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC9Q92623 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC9Q92623 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC9Q92623 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC9Q92623 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC9Q92623 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC9Q92623 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC9Q92623 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC9Q92623 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC9Q92623 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms