Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGP1Q92546 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGP1Q92546 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGP1Q92546 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGP1Q92546 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGP1Q92546 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGP1Q92546 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGP1Q92546 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGP1Q92546 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RGP1Q92546 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RGP1Q92546 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RGP1Q92546 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RGP1Q92546 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RGP1Q92546 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RGP1Q92546 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RGP1Q92546 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RGP1Q92546 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RGP1Q92546 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RGP1Q92546 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RGP1Q92546 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RGP1Q92546 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RGP1Q92546 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RGP1Q92546 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RGP1Q92546 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RGP1Q92546 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RGP1Q92546 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RGP1Q92546 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RGP1Q92546 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RGP1Q92546 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RGP1Q92546 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RGP1Q92546 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RGP1Q92546 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RGP1Q92546 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RGP1Q92546 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RGP1Q92546 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RGP1Q92546 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RGP1Q92546 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RGP1Q92546 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RGP1Q92546 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RGP1Q92546 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RGP1Q92546 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RGP1Q92546 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RGP1Q92546 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RGP1Q92546 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RGP1Q92546 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGP1Q92546 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGP1Q92546 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGP1Q92546 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGP1Q92546 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGP1Q92546 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RGP1Q92546 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RGP1Q92546 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RGP1Q92546 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RGP1Q92546 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RGP1Q92546 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RGP1Q92546 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RGP1Q92546 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RGP1Q92546 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RGP1Q92546 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RGP1Q92546 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RGP1Q92546 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RGP1Q92546 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RGP1Q92546 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGP1Q92546 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGP1Q92546 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGP1Q92546 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGP1Q92546 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGP1Q92546 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGP1Q92546 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RGP1Q92546 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RGP1Q92546 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RGP1Q92546 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RGP1Q92546 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RGP1Q92546 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RGP1Q92546 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RGP1Q92546 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RGP1Q92546 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RGP1Q92546 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RGP1Q92546 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RGP1Q92546 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RGP1Q92546 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RGP1Q92546 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RGP1Q92546 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RGP1Q92546 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RGP1Q92546 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RGP1Q92546 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RGP1Q92546 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGP1Q92546 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGP1Q92546 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGP1Q92546 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGP1Q92546 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGP1Q92546 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGP1Q92546 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGP1Q92546 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGP1Q92546 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGP1Q92546 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGP1Q92546 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGP1Q92546 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGP1Q92546 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RGP1Q92546 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms