Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS9Q8WXC6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS9Q8WXC6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS9Q8WXC6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS9Q8WXC6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS9Q8WXC6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS9Q8WXC6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS9Q8WXC6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS9Q8WXC6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS9Q8WXC6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS9Q8WXC6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS9Q8WXC6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS9Q8WXC6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS9Q8WXC6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS9Q8WXC6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS9Q8WXC6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS9Q8WXC6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS9Q8WXC6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS9Q8WXC6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS9Q8WXC6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS9Q8WXC6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS9Q8WXC6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS9Q8WXC6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS9Q8WXC6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS9Q8WXC6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS9Q8WXC6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS9Q8WXC6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS9Q8WXC6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS9Q8WXC6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS9Q8WXC6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS9Q8WXC6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS9Q8WXC6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS9Q8WXC6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPS9Q8WXC6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPS9Q8WXC6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPS9Q8WXC6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPS9Q8WXC6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPS9Q8WXC6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPS9Q8WXC6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPS9Q8WXC6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPS9Q8WXC6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPS9Q8WXC6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPS9Q8WXC6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPS9Q8WXC6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPS9Q8WXC6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPS9Q8WXC6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPS9Q8WXC6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPS9Q8WXC6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPS9Q8WXC6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPS9Q8WXC6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPS9Q8WXC6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPS9Q8WXC6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPS9Q8WXC6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPS9Q8WXC6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPS9Q8WXC6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPS9Q8WXC6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPS9Q8WXC6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPS9Q8WXC6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPS9Q8WXC6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS9Q8WXC6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS9Q8WXC6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS9Q8WXC6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS9Q8WXC6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS9Q8WXC6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms