Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV41

SNX33, Sorting nexin-33, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX33Q8WV41 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX33Q8WV41 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX33Q8WV41 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX33Q8WV41 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX33Q8WV41 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX33Q8WV41 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX33Q8WV41 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX33Q8WV41 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX33Q8WV41 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX33Q8WV41 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX33Q8WV41 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX33Q8WV41 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX33Q8WV41 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX33Q8WV41 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX33Q8WV41 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX33Q8WV41 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX33Q8WV41 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX33Q8WV41 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX33Q8WV41 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX33Q8WV41 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX33Q8WV41 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX33Q8WV41 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX33Q8WV41 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX33Q8WV41 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX33Q8WV41 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX33Q8WV41 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX33Q8WV41 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX33Q8WV41 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX33Q8WV41 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX33Q8WV41 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX33Q8WV41 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX33Q8WV41 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX33Q8WV41 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX33Q8WV41 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX33Q8WV41 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX33Q8WV41 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX33Q8WV41 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX33Q8WV41 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX33Q8WV41 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX33Q8WV41 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX33Q8WV41 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX33Q8WV41 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX33Q8WV41 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX33Q8WV41 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX33Q8WV41 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX33Q8WV41 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX33Q8WV41 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX33Q8WV41 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX33Q8WV41 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX33Q8WV41 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX33Q8WV41 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX33Q8WV41 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX33Q8WV41 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX33Q8WV41 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX33Q8WV41 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX33Q8WV41 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX33Q8WV41 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX33Q8WV41 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX33Q8WV41 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX33Q8WV41 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX33Q8WV41 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX33Q8WV41 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX33Q8WV41 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX33Q8WV41 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX33Q8WV41 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX33Q8WV41 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX33Q8WV41 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SNX33Q8WV41 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX33Q8WV41 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX33Q8WV41 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX33Q8WV41 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX33Q8WV41 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX33Q8WV41 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX33Q8WV41 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX33Q8WV41 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX33Q8WV41 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX33Q8WV41 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX33Q8WV41 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX33Q8WV41 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX33Q8WV41 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX33Q8WV41 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX33Q8WV41 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX33Q8WV41 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX33Q8WV41 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX33Q8WV41 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX33Q8WV41 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX33Q8WV41 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX33Q8WV41 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX33Q8WV41 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX33Q8WV41 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX33Q8WV41 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX33Q8WV41 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX33Q8WV41 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX33Q8WV41 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX33Q8WV41 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX33Q8WV41 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX33Q8WV41 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX33Q8WV41 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX33Q8WV41 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX33Q8WV41 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.2 ms