Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEC5

SH3RF2, Putative E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF2, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF2Q8TEC5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH3RF2Q8TEC5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SH3RF2Q8TEC5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH3RF2Q8TEC5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SH3RF2Q8TEC5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH3RF2Q8TEC5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH3RF2Q8TEC5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SH3RF2Q8TEC5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SH3RF2Q8TEC5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SH3RF2Q8TEC5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SH3RF2Q8TEC5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH3RF2Q8TEC5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH3RF2Q8TEC5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH3RF2Q8TEC5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH3RF2Q8TEC5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH3RF2Q8TEC5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH3RF2Q8TEC5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SH3RF2Q8TEC5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH3RF2Q8TEC5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3RF2Q8TEC5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3RF2Q8TEC5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3RF2Q8TEC5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3RF2Q8TEC5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3RF2Q8TEC5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3RF2Q8TEC5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH3RF2Q8TEC5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH3RF2Q8TEC5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH3RF2Q8TEC5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH3RF2Q8TEC5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH3RF2Q8TEC5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH3RF2Q8TEC5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SH3RF2Q8TEC5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SH3RF2Q8TEC5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SH3RF2Q8TEC5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SH3RF2Q8TEC5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SH3RF2Q8TEC5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SH3RF2Q8TEC5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SH3RF2Q8TEC5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SH3RF2Q8TEC5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH3RF2Q8TEC5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH3RF2Q8TEC5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH3RF2Q8TEC5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SH3RF2Q8TEC5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH3RF2Q8TEC5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH3RF2Q8TEC5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH3RF2Q8TEC5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SH3RF2Q8TEC5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH3RF2Q8TEC5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SH3RF2Q8TEC5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH3RF2Q8TEC5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH3RF2Q8TEC5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH3RF2Q8TEC5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH3RF2Q8TEC5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH3RF2Q8TEC5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH3RF2Q8TEC5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SH3RF2Q8TEC5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SH3RF2Q8TEC5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SH3RF2Q8TEC5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SH3RF2Q8TEC5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SH3RF2Q8TEC5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SH3RF2Q8TEC5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH3RF2Q8TEC5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH3RF2Q8TEC5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH3RF2Q8TEC5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH3RF2Q8TEC5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH3RF2Q8TEC5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH3RF2Q8TEC5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH3RF2Q8TEC5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH3RF2Q8TEC5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH3RF2Q8TEC5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH3RF2Q8TEC5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH3RF2Q8TEC5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SH3RF2Q8TEC5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SH3RF2Q8TEC5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SH3RF2Q8TEC5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SH3RF2Q8TEC5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SH3RF2Q8TEC5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SH3RF2Q8TEC5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SH3RF2Q8TEC5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SH3RF2Q8TEC5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SH3RF2Q8TEC5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SH3RF2Q8TEC5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SH3RF2Q8TEC5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SH3RF2Q8TEC5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SH3RF2Q8TEC5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SH3RF2Q8TEC5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SH3RF2Q8TEC5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SH3RF2Q8TEC5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SH3RF2Q8TEC5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SH3RF2Q8TEC5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SH3RF2Q8TEC5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SH3RF2Q8TEC5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SH3RF2Q8TEC5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SH3RF2Q8TEC5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SH3RF2Q8TEC5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SH3RF2Q8TEC5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SH3RF2Q8TEC5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SH3RF2Q8TEC5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SH3RF2Q8TEC5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SH3RF2Q8TEC5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms