Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG2

ACTRT1, Actin-related protein T1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT1Q8TDG2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACTRT1Q8TDG2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACTRT1Q8TDG2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACTRT1Q8TDG2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACTRT1Q8TDG2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ACTRT1Q8TDG2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ACTRT1Q8TDG2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACTRT1Q8TDG2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACTRT1Q8TDG2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACTRT1Q8TDG2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACTRT1Q8TDG2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACTRT1Q8TDG2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACTRT1Q8TDG2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACTRT1Q8TDG2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACTRT1Q8TDG2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACTRT1Q8TDG2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACTRT1Q8TDG2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACTRT1Q8TDG2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACTRT1Q8TDG2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ACTRT1Q8TDG2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACTRT1Q8TDG2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACTRT1Q8TDG2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACTRT1Q8TDG2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACTRT1Q8TDG2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACTRT1Q8TDG2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACTRT1Q8TDG2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACTRT1Q8TDG2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACTRT1Q8TDG2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ACTRT1Q8TDG2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ACTRT1Q8TDG2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACTRT1Q8TDG2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACTRT1Q8TDG2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACTRT1Q8TDG2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACTRT1Q8TDG2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACTRT1Q8TDG2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACTRT1Q8TDG2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACTRT1Q8TDG2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACTRT1Q8TDG2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACTRT1Q8TDG2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACTRT1Q8TDG2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACTRT1Q8TDG2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACTRT1Q8TDG2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACTRT1Q8TDG2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACTRT1Q8TDG2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACTRT1Q8TDG2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACTRT1Q8TDG2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACTRT1Q8TDG2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACTRT1Q8TDG2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACTRT1Q8TDG2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACTRT1Q8TDG2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACTRT1Q8TDG2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACTRT1Q8TDG2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACTRT1Q8TDG2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACTRT1Q8TDG2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACTRT1Q8TDG2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACTRT1Q8TDG2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACTRT1Q8TDG2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACTRT1Q8TDG2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACTRT1Q8TDG2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACTRT1Q8TDG2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACTRT1Q8TDG2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACTRT1Q8TDG2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACTRT1Q8TDG2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACTRT1Q8TDG2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACTRT1Q8TDG2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACTRT1Q8TDG2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACTRT1Q8TDG2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACTRT1Q8TDG2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACTRT1Q8TDG2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACTRT1Q8TDG2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACTRT1Q8TDG2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACTRT1Q8TDG2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACTRT1Q8TDG2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ACTRT1Q8TDG2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACTRT1Q8TDG2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACTRT1Q8TDG2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACTRT1Q8TDG2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACTRT1Q8TDG2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACTRT1Q8TDG2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACTRT1Q8TDG2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACTRT1Q8TDG2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACTRT1Q8TDG2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACTRT1Q8TDG2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACTRT1Q8TDG2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACTRT1Q8TDG2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACTRT1Q8TDG2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
ACTRT1Q8TDG2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACTRT1Q8TDG2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ACTRT1Q8TDG2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACTRT1Q8TDG2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACTRT1Q8TDG2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACTRT1Q8TDG2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACTRT1Q8TDG2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACTRT1Q8TDG2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACTRT1Q8TDG2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACTRT1Q8TDG2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACTRT1Q8TDG2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACTRT1Q8TDG2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACTRT1Q8TDG2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACTRT1Q8TDG2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms