Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD35

LKAAEAR1, Protein LKAAEAR1, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LKAAEAR1Q8TD35 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LKAAEAR1Q8TD35 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LKAAEAR1Q8TD35 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LKAAEAR1Q8TD35 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LKAAEAR1Q8TD35 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LKAAEAR1Q8TD35 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LKAAEAR1Q8TD35 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LKAAEAR1Q8TD35 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LKAAEAR1Q8TD35 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LKAAEAR1Q8TD35 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LKAAEAR1Q8TD35 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LKAAEAR1Q8TD35 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LKAAEAR1Q8TD35 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LKAAEAR1Q8TD35 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LKAAEAR1Q8TD35 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LKAAEAR1Q8TD35 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LKAAEAR1Q8TD35 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LKAAEAR1Q8TD35 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LKAAEAR1Q8TD35 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LKAAEAR1Q8TD35 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LKAAEAR1Q8TD35 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LKAAEAR1Q8TD35 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LKAAEAR1Q8TD35 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LKAAEAR1Q8TD35 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LKAAEAR1Q8TD35 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LKAAEAR1Q8TD35 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LKAAEAR1Q8TD35 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LKAAEAR1Q8TD35 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LKAAEAR1Q8TD35 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LKAAEAR1Q8TD35 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LKAAEAR1Q8TD35 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LKAAEAR1Q8TD35 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LKAAEAR1Q8TD35 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LKAAEAR1Q8TD35 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
LKAAEAR1Q8TD35 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LKAAEAR1Q8TD35 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LKAAEAR1Q8TD35 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LKAAEAR1Q8TD35 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LKAAEAR1Q8TD35 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LKAAEAR1Q8TD35 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LKAAEAR1Q8TD35 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LKAAEAR1Q8TD35 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LKAAEAR1Q8TD35 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LKAAEAR1Q8TD35 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LKAAEAR1Q8TD35 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LKAAEAR1Q8TD35 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LKAAEAR1Q8TD35 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LKAAEAR1Q8TD35 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LKAAEAR1Q8TD35 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LKAAEAR1Q8TD35 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LKAAEAR1Q8TD35 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LKAAEAR1Q8TD35 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LKAAEAR1Q8TD35 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LKAAEAR1Q8TD35 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LKAAEAR1Q8TD35 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LKAAEAR1Q8TD35 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LKAAEAR1Q8TD35 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LKAAEAR1Q8TD35 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LKAAEAR1Q8TD35 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LKAAEAR1Q8TD35 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LKAAEAR1Q8TD35 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LKAAEAR1Q8TD35 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LKAAEAR1Q8TD35 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LKAAEAR1Q8TD35 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LKAAEAR1Q8TD35 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LKAAEAR1Q8TD35 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LKAAEAR1Q8TD35 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LKAAEAR1Q8TD35 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LKAAEAR1Q8TD35 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LKAAEAR1Q8TD35 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LKAAEAR1Q8TD35 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LKAAEAR1Q8TD35 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LKAAEAR1Q8TD35 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LKAAEAR1Q8TD35 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LKAAEAR1Q8TD35 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LKAAEAR1Q8TD35 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LKAAEAR1Q8TD35 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LKAAEAR1Q8TD35 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LKAAEAR1Q8TD35 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LKAAEAR1Q8TD35 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LKAAEAR1Q8TD35 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LKAAEAR1Q8TD35 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LKAAEAR1Q8TD35 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LKAAEAR1Q8TD35 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LKAAEAR1Q8TD35 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LKAAEAR1Q8TD35 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LKAAEAR1Q8TD35 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LKAAEAR1Q8TD35 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LKAAEAR1Q8TD35 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LKAAEAR1Q8TD35 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LKAAEAR1Q8TD35 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LKAAEAR1Q8TD35 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LKAAEAR1Q8TD35 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LKAAEAR1Q8TD35 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LKAAEAR1Q8TD35 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LKAAEAR1Q8TD35 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LKAAEAR1Q8TD35 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LKAAEAR1Q8TD35 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LKAAEAR1Q8TD35 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LKAAEAR1Q8TD35 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms