Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA6DQ8NFY4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA6DQ8NFY4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA6DQ8NFY4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA6DQ8NFY4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA6DQ8NFY4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA6DQ8NFY4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA6DQ8NFY4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA6DQ8NFY4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA6DQ8NFY4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA6DQ8NFY4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA6DQ8NFY4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA6DQ8NFY4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA6DQ8NFY4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA6DQ8NFY4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA6DQ8NFY4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA6DQ8NFY4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA6DQ8NFY4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA6DQ8NFY4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA6DQ8NFY4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA6DQ8NFY4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA6DQ8NFY4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA6DQ8NFY4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA6DQ8NFY4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA6DQ8NFY4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA6DQ8NFY4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA6DQ8NFY4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA6DQ8NFY4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA6DQ8NFY4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA6DQ8NFY4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA6DQ8NFY4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA6DQ8NFY4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA6DQ8NFY4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA6DQ8NFY4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA6DQ8NFY4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA6DQ8NFY4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA6DQ8NFY4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA6DQ8NFY4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA6DQ8NFY4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA6DQ8NFY4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA6DQ8NFY4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA6DQ8NFY4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA6DQ8NFY4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA6DQ8NFY4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA6DQ8NFY4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA6DQ8NFY4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA6DQ8NFY4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA6DQ8NFY4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA6DQ8NFY4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEMA6DQ8NFY4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEMA6DQ8NFY4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA6DQ8NFY4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA6DQ8NFY4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA6DQ8NFY4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA6DQ8NFY4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA6DQ8NFY4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA6DQ8NFY4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA6DQ8NFY4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA6DQ8NFY4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA6DQ8NFY4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA6DQ8NFY4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA6DQ8NFY4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA6DQ8NFY4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA6DQ8NFY4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA6DQ8NFY4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA6DQ8NFY4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA6DQ8NFY4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA6DQ8NFY4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA6DQ8NFY4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA6DQ8NFY4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA6DQ8NFY4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA6DQ8NFY4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA6DQ8NFY4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA6DQ8NFY4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA6DQ8NFY4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA6DQ8NFY4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA6DQ8NFY4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA6DQ8NFY4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA6DQ8NFY4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA6DQ8NFY4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA6DQ8NFY4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA6DQ8NFY4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA6DQ8NFY4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA6DQ8NFY4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA6DQ8NFY4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA6DQ8NFY4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA6DQ8NFY4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA6DQ8NFY4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SEMA6DQ8NFY4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA6DQ8NFY4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA6DQ8NFY4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA6DQ8NFY4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA6DQ8NFY4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA6DQ8NFY4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA6DQ8NFY4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA6DQ8NFY4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA6DQ8NFY4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA6DQ8NFY4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA6DQ8NFY4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms