Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ9

BBS1, Bardet-Biedl syndrome 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS1Q8NFJ9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBS1Q8NFJ9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBS1Q8NFJ9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBS1Q8NFJ9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBS1Q8NFJ9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBS1Q8NFJ9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BBS1Q8NFJ9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBS1Q8NFJ9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBS1Q8NFJ9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBS1Q8NFJ9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBS1Q8NFJ9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBS1Q8NFJ9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BBS1Q8NFJ9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBS1Q8NFJ9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBS1Q8NFJ9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS1Q8NFJ9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS1Q8NFJ9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS1Q8NFJ9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS1Q8NFJ9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS1Q8NFJ9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS1Q8NFJ9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS1Q8NFJ9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS1Q8NFJ9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BBS1Q8NFJ9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BBS1Q8NFJ9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BBS1Q8NFJ9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBS1Q8NFJ9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBS1Q8NFJ9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS1Q8NFJ9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS1Q8NFJ9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS1Q8NFJ9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS1Q8NFJ9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS1Q8NFJ9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS1Q8NFJ9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS1Q8NFJ9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS1Q8NFJ9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS1Q8NFJ9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS1Q8NFJ9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS1Q8NFJ9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS1Q8NFJ9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS1Q8NFJ9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS1Q8NFJ9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS1Q8NFJ9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS1Q8NFJ9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS1Q8NFJ9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS1Q8NFJ9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS1Q8NFJ9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS1Q8NFJ9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS1Q8NFJ9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS1Q8NFJ9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS1Q8NFJ9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS1Q8NFJ9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBS1Q8NFJ9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBS1Q8NFJ9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBS1Q8NFJ9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBS1Q8NFJ9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BBS1Q8NFJ9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBS1Q8NFJ9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BBS1Q8NFJ9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS1Q8NFJ9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS1Q8NFJ9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS1Q8NFJ9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS1Q8NFJ9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS1Q8NFJ9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS1Q8NFJ9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS1Q8NFJ9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS1Q8NFJ9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS1Q8NFJ9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS1Q8NFJ9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS1Q8NFJ9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS1Q8NFJ9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS1Q8NFJ9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS1Q8NFJ9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS1Q8NFJ9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS1Q8NFJ9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS1Q8NFJ9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS1Q8NFJ9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS1Q8NFJ9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS1Q8NFJ9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBS1Q8NFJ9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBS1Q8NFJ9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBS1Q8NFJ9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBS1Q8NFJ9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBS1Q8NFJ9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBS1Q8NFJ9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBS1Q8NFJ9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBS1Q8NFJ9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBS1Q8NFJ9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBS1Q8NFJ9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBS1Q8NFJ9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BBS1Q8NFJ9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBS1Q8NFJ9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBS1Q8NFJ9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBS1Q8NFJ9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBS1Q8NFJ9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BBS1Q8NFJ9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BBS1Q8NFJ9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BBS1Q8NFJ9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BBS1Q8NFJ9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BBS1Q8NFJ9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms