Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEA6

GLIS3, Zinc finger protein GLIS3, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS3Q8NEA6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GLIS3Q8NEA6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GLIS3Q8NEA6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GLIS3Q8NEA6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GLIS3Q8NEA6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GLIS3Q8NEA6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GLIS3Q8NEA6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GLIS3Q8NEA6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GLIS3Q8NEA6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GLIS3Q8NEA6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GLIS3Q8NEA6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GLIS3Q8NEA6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GLIS3Q8NEA6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GLIS3Q8NEA6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GLIS3Q8NEA6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GLIS3Q8NEA6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GLIS3Q8NEA6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GLIS3Q8NEA6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GLIS3Q8NEA6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GLIS3Q8NEA6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GLIS3Q8NEA6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GLIS3Q8NEA6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GLIS3Q8NEA6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GLIS3Q8NEA6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GLIS3Q8NEA6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GLIS3Q8NEA6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GLIS3Q8NEA6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GLIS3Q8NEA6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GLIS3Q8NEA6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GLIS3Q8NEA6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GLIS3Q8NEA6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GLIS3Q8NEA6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GLIS3Q8NEA6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GLIS3Q8NEA6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GLIS3Q8NEA6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GLIS3Q8NEA6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GLIS3Q8NEA6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GLIS3Q8NEA6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GLIS3Q8NEA6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GLIS3Q8NEA6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GLIS3Q8NEA6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GLIS3Q8NEA6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GLIS3Q8NEA6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GLIS3Q8NEA6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GLIS3Q8NEA6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GLIS3Q8NEA6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GLIS3Q8NEA6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GLIS3Q8NEA6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GLIS3Q8NEA6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GLIS3Q8NEA6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GLIS3Q8NEA6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GLIS3Q8NEA6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GLIS3Q8NEA6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GLIS3Q8NEA6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GLIS3Q8NEA6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GLIS3Q8NEA6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GLIS3Q8NEA6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GLIS3Q8NEA6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GLIS3Q8NEA6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GLIS3Q8NEA6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GLIS3Q8NEA6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GLIS3Q8NEA6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GLIS3Q8NEA6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GLIS3Q8NEA6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GLIS3Q8NEA6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GLIS3Q8NEA6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GLIS3Q8NEA6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GLIS3Q8NEA6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GLIS3Q8NEA6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
GLIS3Q8NEA6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
GLIS3Q8NEA6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GLIS3Q8NEA6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GLIS3Q8NEA6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
GLIS3Q8NEA6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GLIS3Q8NEA6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GLIS3Q8NEA6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GLIS3Q8NEA6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GLIS3Q8NEA6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GLIS3Q8NEA6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GLIS3Q8NEA6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GLIS3Q8NEA6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GLIS3Q8NEA6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GLIS3Q8NEA6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GLIS3Q8NEA6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GLIS3Q8NEA6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GLIS3Q8NEA6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GLIS3Q8NEA6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GLIS3Q8NEA6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GLIS3Q8NEA6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GLIS3Q8NEA6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GLIS3Q8NEA6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GLIS3Q8NEA6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GLIS3Q8NEA6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GLIS3Q8NEA6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GLIS3Q8NEA6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GLIS3Q8NEA6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GLIS3Q8NEA6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GLIS3Q8NEA6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GLIS3Q8NEA6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GLIS3Q8NEA6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms