Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBW4

SLC38A9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A9Q8NBW4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC38A9Q8NBW4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC38A9Q8NBW4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC38A9Q8NBW4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC38A9Q8NBW4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC38A9Q8NBW4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC38A9Q8NBW4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC38A9Q8NBW4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC38A9Q8NBW4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC38A9Q8NBW4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC38A9Q8NBW4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC38A9Q8NBW4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC38A9Q8NBW4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC38A9Q8NBW4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC38A9Q8NBW4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC38A9Q8NBW4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC38A9Q8NBW4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC38A9Q8NBW4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC38A9Q8NBW4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC38A9Q8NBW4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC38A9Q8NBW4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC38A9Q8NBW4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC38A9Q8NBW4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC38A9Q8NBW4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC38A9Q8NBW4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC38A9Q8NBW4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC38A9Q8NBW4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC38A9Q8NBW4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC38A9Q8NBW4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC38A9Q8NBW4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC38A9Q8NBW4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC38A9Q8NBW4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC38A9Q8NBW4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC38A9Q8NBW4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC38A9Q8NBW4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC38A9Q8NBW4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC38A9Q8NBW4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC38A9Q8NBW4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC38A9Q8NBW4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC38A9Q8NBW4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC38A9Q8NBW4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC38A9Q8NBW4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC38A9Q8NBW4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC38A9Q8NBW4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC38A9Q8NBW4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC38A9Q8NBW4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC38A9Q8NBW4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC38A9Q8NBW4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC38A9Q8NBW4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC38A9Q8NBW4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC38A9Q8NBW4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC38A9Q8NBW4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC38A9Q8NBW4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC38A9Q8NBW4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC38A9Q8NBW4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC38A9Q8NBW4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC38A9Q8NBW4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC38A9Q8NBW4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC38A9Q8NBW4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC38A9Q8NBW4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC38A9Q8NBW4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC38A9Q8NBW4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC38A9Q8NBW4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC38A9Q8NBW4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC38A9Q8NBW4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC38A9Q8NBW4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC38A9Q8NBW4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC38A9Q8NBW4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC38A9Q8NBW4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC38A9Q8NBW4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC38A9Q8NBW4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC38A9Q8NBW4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC38A9Q8NBW4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC38A9Q8NBW4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC38A9Q8NBW4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC38A9Q8NBW4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC38A9Q8NBW4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC38A9Q8NBW4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC38A9Q8NBW4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC38A9Q8NBW4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC38A9Q8NBW4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC38A9Q8NBW4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC38A9Q8NBW4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC38A9Q8NBW4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC38A9Q8NBW4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC38A9Q8NBW4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC38A9Q8NBW4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC38A9Q8NBW4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC38A9Q8NBW4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC38A9Q8NBW4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC38A9Q8NBW4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC38A9Q8NBW4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC38A9Q8NBW4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC38A9Q8NBW4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC38A9Q8NBW4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC38A9Q8NBW4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC38A9Q8NBW4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC38A9Q8NBW4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC38A9Q8NBW4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC38A9Q8NBW4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms