Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COLGALT1Q8NBJ5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COLGALT1Q8NBJ5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COLGALT1Q8NBJ5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
COLGALT1Q8NBJ5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COLGALT1Q8NBJ5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COLGALT1Q8NBJ5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COLGALT1Q8NBJ5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COLGALT1Q8NBJ5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COLGALT1Q8NBJ5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COLGALT1Q8NBJ5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COLGALT1Q8NBJ5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COLGALT1Q8NBJ5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COLGALT1Q8NBJ5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COLGALT1Q8NBJ5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COLGALT1Q8NBJ5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COLGALT1Q8NBJ5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COLGALT1Q8NBJ5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
COLGALT1Q8NBJ5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COLGALT1Q8NBJ5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COLGALT1Q8NBJ5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
COLGALT1Q8NBJ5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
COLGALT1Q8NBJ5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COLGALT1Q8NBJ5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
COLGALT1Q8NBJ5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COLGALT1Q8NBJ5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COLGALT1Q8NBJ5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COLGALT1Q8NBJ5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COLGALT1Q8NBJ5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COLGALT1Q8NBJ5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COLGALT1Q8NBJ5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COLGALT1Q8NBJ5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COLGALT1Q8NBJ5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
COLGALT1Q8NBJ5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COLGALT1Q8NBJ5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COLGALT1Q8NBJ5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COLGALT1Q8NBJ5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COLGALT1Q8NBJ5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COLGALT1Q8NBJ5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
COLGALT1Q8NBJ5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COLGALT1Q8NBJ5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COLGALT1Q8NBJ5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
COLGALT1Q8NBJ5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COLGALT1Q8NBJ5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COLGALT1Q8NBJ5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
COLGALT1Q8NBJ5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COLGALT1Q8NBJ5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COLGALT1Q8NBJ5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COLGALT1Q8NBJ5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COLGALT1Q8NBJ5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COLGALT1Q8NBJ5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COLGALT1Q8NBJ5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COLGALT1Q8NBJ5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COLGALT1Q8NBJ5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COLGALT1Q8NBJ5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COLGALT1Q8NBJ5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COLGALT1Q8NBJ5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COLGALT1Q8NBJ5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COLGALT1Q8NBJ5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
COLGALT1Q8NBJ5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COLGALT1Q8NBJ5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COLGALT1Q8NBJ5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COLGALT1Q8NBJ5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COLGALT1Q8NBJ5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
COLGALT1Q8NBJ5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
COLGALT1Q8NBJ5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COLGALT1Q8NBJ5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COLGALT1Q8NBJ5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COLGALT1Q8NBJ5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
COLGALT1Q8NBJ5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
COLGALT1Q8NBJ5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COLGALT1Q8NBJ5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
COLGALT1Q8NBJ5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COLGALT1Q8NBJ5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COLGALT1Q8NBJ5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COLGALT1Q8NBJ5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COLGALT1Q8NBJ5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COLGALT1Q8NBJ5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
COLGALT1Q8NBJ5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COLGALT1Q8NBJ5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COLGALT1Q8NBJ5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COLGALT1Q8NBJ5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COLGALT1Q8NBJ5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COLGALT1Q8NBJ5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
COLGALT1Q8NBJ5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COLGALT1Q8NBJ5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COLGALT1Q8NBJ5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COLGALT1Q8NBJ5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COLGALT1Q8NBJ5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COLGALT1Q8NBJ5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COLGALT1Q8NBJ5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COLGALT1Q8NBJ5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
COLGALT1Q8NBJ5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
COLGALT1Q8NBJ5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COLGALT1Q8NBJ5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
COLGALT1Q8NBJ5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
COLGALT1Q8NBJ5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
COLGALT1Q8NBJ5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.8 ms