Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5J2

MINDY1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY1Q8N5J2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MINDY1Q8N5J2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MINDY1Q8N5J2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MINDY1Q8N5J2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MINDY1Q8N5J2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MINDY1Q8N5J2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MINDY1Q8N5J2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MINDY1Q8N5J2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MINDY1Q8N5J2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MINDY1Q8N5J2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MINDY1Q8N5J2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MINDY1Q8N5J2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MINDY1Q8N5J2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MINDY1Q8N5J2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MINDY1Q8N5J2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MINDY1Q8N5J2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MINDY1Q8N5J2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MINDY1Q8N5J2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MINDY1Q8N5J2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MINDY1Q8N5J2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MINDY1Q8N5J2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MINDY1Q8N5J2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MINDY1Q8N5J2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MINDY1Q8N5J2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MINDY1Q8N5J2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MINDY1Q8N5J2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MINDY1Q8N5J2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MINDY1Q8N5J2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MINDY1Q8N5J2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MINDY1Q8N5J2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MINDY1Q8N5J2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MINDY1Q8N5J2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MINDY1Q8N5J2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MINDY1Q8N5J2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MINDY1Q8N5J2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MINDY1Q8N5J2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MINDY1Q8N5J2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MINDY1Q8N5J2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MINDY1Q8N5J2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MINDY1Q8N5J2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MINDY1Q8N5J2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MINDY1Q8N5J2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MINDY1Q8N5J2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MINDY1Q8N5J2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MINDY1Q8N5J2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MINDY1Q8N5J2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MINDY1Q8N5J2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MINDY1Q8N5J2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MINDY1Q8N5J2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MINDY1Q8N5J2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MINDY1Q8N5J2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MINDY1Q8N5J2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MINDY1Q8N5J2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MINDY1Q8N5J2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MINDY1Q8N5J2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MINDY1Q8N5J2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MINDY1Q8N5J2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MINDY1Q8N5J2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MINDY1Q8N5J2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MINDY1Q8N5J2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MINDY1Q8N5J2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MINDY1Q8N5J2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MINDY1Q8N5J2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MINDY1Q8N5J2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MINDY1Q8N5J2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MINDY1Q8N5J2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MINDY1Q8N5J2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MINDY1Q8N5J2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MINDY1Q8N5J2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MINDY1Q8N5J2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MINDY1Q8N5J2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MINDY1Q8N5J2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MINDY1Q8N5J2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MINDY1Q8N5J2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MINDY1Q8N5J2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MINDY1Q8N5J2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MINDY1Q8N5J2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MINDY1Q8N5J2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MINDY1Q8N5J2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MINDY1Q8N5J2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MINDY1Q8N5J2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MINDY1Q8N5J2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MINDY1Q8N5J2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MINDY1Q8N5J2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MINDY1Q8N5J2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MINDY1Q8N5J2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MINDY1Q8N5J2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MINDY1Q8N5J2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MINDY1Q8N5J2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MINDY1Q8N5J2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MINDY1Q8N5J2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MINDY1Q8N5J2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MINDY1Q8N5J2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MINDY1Q8N5J2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MINDY1Q8N5J2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MINDY1Q8N5J2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MINDY1Q8N5J2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MINDY1Q8N5J2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MINDY1Q8N5J2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MINDY1Q8N5J2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms