Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLIP4Q8N3C7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLIP4Q8N3C7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLIP4Q8N3C7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLIP4Q8N3C7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLIP4Q8N3C7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLIP4Q8N3C7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLIP4Q8N3C7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLIP4Q8N3C7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLIP4Q8N3C7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLIP4Q8N3C7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLIP4Q8N3C7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLIP4Q8N3C7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLIP4Q8N3C7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLIP4Q8N3C7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLIP4Q8N3C7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLIP4Q8N3C7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLIP4Q8N3C7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLIP4Q8N3C7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLIP4Q8N3C7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLIP4Q8N3C7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLIP4Q8N3C7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLIP4Q8N3C7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLIP4Q8N3C7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLIP4Q8N3C7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLIP4Q8N3C7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLIP4Q8N3C7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLIP4Q8N3C7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLIP4Q8N3C7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLIP4Q8N3C7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLIP4Q8N3C7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLIP4Q8N3C7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLIP4Q8N3C7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLIP4Q8N3C7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLIP4Q8N3C7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLIP4Q8N3C7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLIP4Q8N3C7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLIP4Q8N3C7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLIP4Q8N3C7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLIP4Q8N3C7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLIP4Q8N3C7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLIP4Q8N3C7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLIP4Q8N3C7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLIP4Q8N3C7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLIP4Q8N3C7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLIP4Q8N3C7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLIP4Q8N3C7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLIP4Q8N3C7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLIP4Q8N3C7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLIP4Q8N3C7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLIP4Q8N3C7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLIP4Q8N3C7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLIP4Q8N3C7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLIP4Q8N3C7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLIP4Q8N3C7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLIP4Q8N3C7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLIP4Q8N3C7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLIP4Q8N3C7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLIP4Q8N3C7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIP4Q8N3C7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIP4Q8N3C7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIP4Q8N3C7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIP4Q8N3C7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIP4Q8N3C7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIP4Q8N3C7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIP4Q8N3C7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIP4Q8N3C7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIP4Q8N3C7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIP4Q8N3C7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIP4Q8N3C7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIP4Q8N3C7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIP4Q8N3C7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIP4Q8N3C7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLIP4Q8N3C7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLIP4Q8N3C7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLIP4Q8N3C7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLIP4Q8N3C7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLIP4Q8N3C7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLIP4Q8N3C7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLIP4Q8N3C7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CLIP4Q8N3C7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLIP4Q8N3C7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLIP4Q8N3C7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLIP4Q8N3C7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLIP4Q8N3C7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLIP4Q8N3C7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLIP4Q8N3C7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLIP4Q8N3C7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLIP4Q8N3C7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLIP4Q8N3C7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLIP4Q8N3C7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLIP4Q8N3C7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLIP4Q8N3C7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLIP4Q8N3C7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLIP4Q8N3C7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIP4Q8N3C7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIP4Q8N3C7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIP4Q8N3C7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIP4Q8N3C7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIP4Q8N3C7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
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