Protein–RNA interactions for Protein: Q8N159

NAGS, N-acetylglutamate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAGSQ8N159 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NAGSQ8N159 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NAGSQ8N159 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NAGSQ8N159 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NAGSQ8N159 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NAGSQ8N159 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NAGSQ8N159 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NAGSQ8N159 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NAGSQ8N159 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NAGSQ8N159 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NAGSQ8N159 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NAGSQ8N159 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NAGSQ8N159 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NAGSQ8N159 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NAGSQ8N159 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NAGSQ8N159 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NAGSQ8N159 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NAGSQ8N159 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NAGSQ8N159 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NAGSQ8N159 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NAGSQ8N159 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NAGSQ8N159 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NAGSQ8N159 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NAGSQ8N159 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NAGSQ8N159 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NAGSQ8N159 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NAGSQ8N159 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NAGSQ8N159 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NAGSQ8N159 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NAGSQ8N159 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NAGSQ8N159 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NAGSQ8N159 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NAGSQ8N159 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NAGSQ8N159 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NAGSQ8N159 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NAGSQ8N159 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NAGSQ8N159 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NAGSQ8N159 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NAGSQ8N159 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NAGSQ8N159 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NAGSQ8N159 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NAGSQ8N159 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NAGSQ8N159 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NAGSQ8N159 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NAGSQ8N159 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NAGSQ8N159 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NAGSQ8N159 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NAGSQ8N159 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NAGSQ8N159 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NAGSQ8N159 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NAGSQ8N159 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NAGSQ8N159 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NAGSQ8N159 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NAGSQ8N159 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NAGSQ8N159 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NAGSQ8N159 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NAGSQ8N159 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NAGSQ8N159 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NAGSQ8N159 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NAGSQ8N159 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NAGSQ8N159 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NAGSQ8N159 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NAGSQ8N159 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NAGSQ8N159 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NAGSQ8N159 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NAGSQ8N159 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NAGSQ8N159 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NAGSQ8N159 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NAGSQ8N159 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NAGSQ8N159 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NAGSQ8N159 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NAGSQ8N159 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NAGSQ8N159 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NAGSQ8N159 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NAGSQ8N159 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NAGSQ8N159 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NAGSQ8N159 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NAGSQ8N159 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NAGSQ8N159 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NAGSQ8N159 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NAGSQ8N159 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NAGSQ8N159 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NAGSQ8N159 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NAGSQ8N159 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NAGSQ8N159 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NAGSQ8N159 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NAGSQ8N159 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NAGSQ8N159 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NAGSQ8N159 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NAGSQ8N159 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NAGSQ8N159 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NAGSQ8N159 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NAGSQ8N159 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NAGSQ8N159 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NAGSQ8N159 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NAGSQ8N159 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NAGSQ8N159 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NAGSQ8N159 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NAGSQ8N159 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NAGSQ8N159 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms