Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPFIBP1Q86W92 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPFIBP1Q86W92 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPFIBP1Q86W92 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PPFIBP1Q86W92 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPFIBP1Q86W92 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPFIBP1Q86W92 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPFIBP1Q86W92 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPFIBP1Q86W92 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPFIBP1Q86W92 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPFIBP1Q86W92 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPFIBP1Q86W92 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPFIBP1Q86W92 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPFIBP1Q86W92 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPFIBP1Q86W92 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPFIBP1Q86W92 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PPFIBP1Q86W92 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPFIBP1Q86W92 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPFIBP1Q86W92 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PPFIBP1Q86W92 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
PPFIBP1Q86W92 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPFIBP1Q86W92 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPFIBP1Q86W92 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PPFIBP1Q86W92 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PPFIBP1Q86W92 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PPFIBP1Q86W92 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPFIBP1Q86W92 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PPFIBP1Q86W92 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPFIBP1Q86W92 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PPFIBP1Q86W92 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PPFIBP1Q86W92 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PPFIBP1Q86W92 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PPFIBP1Q86W92 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PPFIBP1Q86W92 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
PPFIBP1Q86W92 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPFIBP1Q86W92 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPFIBP1Q86W92 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPFIBP1Q86W92 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPFIBP1Q86W92 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPFIBP1Q86W92 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PPFIBP1Q86W92 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PPFIBP1Q86W92 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPFIBP1Q86W92 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPFIBP1Q86W92 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PPFIBP1Q86W92 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPFIBP1Q86W92 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPFIBP1Q86W92 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPFIBP1Q86W92 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPFIBP1Q86W92 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPFIBP1Q86W92 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPFIBP1Q86W92 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPFIBP1Q86W92 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPFIBP1Q86W92 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPFIBP1Q86W92 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPFIBP1Q86W92 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPFIBP1Q86W92 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPFIBP1Q86W92 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PPFIBP1Q86W92 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPFIBP1Q86W92 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPFIBP1Q86W92 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPFIBP1Q86W92 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPFIBP1Q86W92 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPFIBP1Q86W92 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PPFIBP1Q86W92 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPFIBP1Q86W92 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPFIBP1Q86W92 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPFIBP1Q86W92 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPFIBP1Q86W92 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPFIBP1Q86W92 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPFIBP1Q86W92 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPFIBP1Q86W92 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPFIBP1Q86W92 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPFIBP1Q86W92 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPFIBP1Q86W92 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPFIBP1Q86W92 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPFIBP1Q86W92 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPFIBP1Q86W92 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
PPFIBP1Q86W92 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
PPFIBP1Q86W92 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PPFIBP1Q86W92 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PPFIBP1Q86W92 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPFIBP1Q86W92 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPFIBP1Q86W92 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPFIBP1Q86W92 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPFIBP1Q86W92 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPFIBP1Q86W92 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPFIBP1Q86W92 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPFIBP1Q86W92 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPFIBP1Q86W92 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPFIBP1Q86W92 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPFIBP1Q86W92 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPFIBP1Q86W92 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPFIBP1Q86W92 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPFIBP1Q86W92 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPFIBP1Q86W92 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPFIBP1Q86W92 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPFIBP1Q86W92 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPFIBP1Q86W92 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PPFIBP1Q86W92 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPFIBP1Q86W92 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms