Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT5

PDZD3, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD3Q86UT5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDZD3Q86UT5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDZD3Q86UT5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDZD3Q86UT5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDZD3Q86UT5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDZD3Q86UT5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDZD3Q86UT5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDZD3Q86UT5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDZD3Q86UT5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDZD3Q86UT5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDZD3Q86UT5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDZD3Q86UT5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDZD3Q86UT5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDZD3Q86UT5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PDZD3Q86UT5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDZD3Q86UT5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDZD3Q86UT5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDZD3Q86UT5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDZD3Q86UT5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDZD3Q86UT5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDZD3Q86UT5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDZD3Q86UT5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDZD3Q86UT5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDZD3Q86UT5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PDZD3Q86UT5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDZD3Q86UT5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDZD3Q86UT5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDZD3Q86UT5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDZD3Q86UT5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDZD3Q86UT5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDZD3Q86UT5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDZD3Q86UT5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZD3Q86UT5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZD3Q86UT5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZD3Q86UT5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZD3Q86UT5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDZD3Q86UT5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDZD3Q86UT5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDZD3Q86UT5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDZD3Q86UT5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZD3Q86UT5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZD3Q86UT5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZD3Q86UT5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZD3Q86UT5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZD3Q86UT5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZD3Q86UT5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZD3Q86UT5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZD3Q86UT5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZD3Q86UT5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZD3Q86UT5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZD3Q86UT5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZD3Q86UT5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZD3Q86UT5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDZD3Q86UT5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDZD3Q86UT5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDZD3Q86UT5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDZD3Q86UT5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDZD3Q86UT5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDZD3Q86UT5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDZD3Q86UT5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDZD3Q86UT5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PDZD3Q86UT5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PDZD3Q86UT5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDZD3Q86UT5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZD3Q86UT5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZD3Q86UT5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZD3Q86UT5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZD3Q86UT5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZD3Q86UT5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZD3Q86UT5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZD3Q86UT5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZD3Q86UT5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZD3Q86UT5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZD3Q86UT5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZD3Q86UT5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZD3Q86UT5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZD3Q86UT5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZD3Q86UT5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZD3Q86UT5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZD3Q86UT5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZD3Q86UT5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZD3Q86UT5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZD3Q86UT5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZD3Q86UT5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZD3Q86UT5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZD3Q86UT5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZD3Q86UT5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZD3Q86UT5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZD3Q86UT5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZD3Q86UT5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZD3Q86UT5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZD3Q86UT5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZD3Q86UT5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDZD3Q86UT5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PDZD3Q86UT5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDZD3Q86UT5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDZD3Q86UT5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZD3Q86UT5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZD3Q86UT5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZD3Q86UT5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms