Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4H3

HDDC2, HD domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC2Q7Z4H3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDDC2Q7Z4H3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDDC2Q7Z4H3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDDC2Q7Z4H3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDDC2Q7Z4H3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDDC2Q7Z4H3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDDC2Q7Z4H3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDDC2Q7Z4H3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDDC2Q7Z4H3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDDC2Q7Z4H3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDDC2Q7Z4H3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDDC2Q7Z4H3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDDC2Q7Z4H3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDDC2Q7Z4H3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDDC2Q7Z4H3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDDC2Q7Z4H3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDDC2Q7Z4H3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDDC2Q7Z4H3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDDC2Q7Z4H3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDDC2Q7Z4H3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDDC2Q7Z4H3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HDDC2Q7Z4H3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDDC2Q7Z4H3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDDC2Q7Z4H3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDDC2Q7Z4H3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDDC2Q7Z4H3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDDC2Q7Z4H3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDDC2Q7Z4H3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDDC2Q7Z4H3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDDC2Q7Z4H3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDDC2Q7Z4H3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDDC2Q7Z4H3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDDC2Q7Z4H3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDDC2Q7Z4H3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDDC2Q7Z4H3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDDC2Q7Z4H3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDDC2Q7Z4H3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDDC2Q7Z4H3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDDC2Q7Z4H3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDDC2Q7Z4H3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDDC2Q7Z4H3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDDC2Q7Z4H3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDDC2Q7Z4H3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDDC2Q7Z4H3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HDDC2Q7Z4H3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDDC2Q7Z4H3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDDC2Q7Z4H3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDDC2Q7Z4H3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDDC2Q7Z4H3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDDC2Q7Z4H3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDDC2Q7Z4H3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDDC2Q7Z4H3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDDC2Q7Z4H3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDDC2Q7Z4H3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
HDDC2Q7Z4H3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HDDC2Q7Z4H3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDDC2Q7Z4H3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDDC2Q7Z4H3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDDC2Q7Z4H3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDDC2Q7Z4H3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDDC2Q7Z4H3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDDC2Q7Z4H3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDDC2Q7Z4H3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDDC2Q7Z4H3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDDC2Q7Z4H3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDDC2Q7Z4H3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDDC2Q7Z4H3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDDC2Q7Z4H3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDDC2Q7Z4H3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDDC2Q7Z4H3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDDC2Q7Z4H3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDDC2Q7Z4H3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDDC2Q7Z4H3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDDC2Q7Z4H3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDDC2Q7Z4H3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDDC2Q7Z4H3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDDC2Q7Z4H3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDDC2Q7Z4H3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDDC2Q7Z4H3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDDC2Q7Z4H3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDDC2Q7Z4H3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDDC2Q7Z4H3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDDC2Q7Z4H3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDDC2Q7Z4H3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDDC2Q7Z4H3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDDC2Q7Z4H3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDDC2Q7Z4H3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HDDC2Q7Z4H3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDDC2Q7Z4H3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDDC2Q7Z4H3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDDC2Q7Z4H3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDDC2Q7Z4H3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDDC2Q7Z4H3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDDC2Q7Z4H3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDDC2Q7Z4H3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDDC2Q7Z4H3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HDDC2Q7Z4H3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDDC2Q7Z4H3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDDC2Q7Z4H3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HDDC2Q7Z4H3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms