Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RUFY3Q7L099 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RUFY3Q7L099 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RUFY3Q7L099 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RUFY3Q7L099 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RUFY3Q7L099 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RUFY3Q7L099 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RUFY3Q7L099 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RUFY3Q7L099 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RUFY3Q7L099 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
RUFY3Q7L099 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
RUFY3Q7L099 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RUFY3Q7L099 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
RUFY3Q7L099 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RUFY3Q7L099 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
RUFY3Q7L099 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RUFY3Q7L099 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RUFY3Q7L099 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
RUFY3Q7L099 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RUFY3Q7L099 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RUFY3Q7L099 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RUFY3Q7L099 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RUFY3Q7L099 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RUFY3Q7L099 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RUFY3Q7L099 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RUFY3Q7L099 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RUFY3Q7L099 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RUFY3Q7L099 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RUFY3Q7L099 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RUFY3Q7L099 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RUFY3Q7L099 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RUFY3Q7L099 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RUFY3Q7L099 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RUFY3Q7L099 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RUFY3Q7L099 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RUFY3Q7L099 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RUFY3Q7L099 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RUFY3Q7L099 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RUFY3Q7L099 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
RUFY3Q7L099 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RUFY3Q7L099 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RUFY3Q7L099 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RUFY3Q7L099 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RUFY3Q7L099 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RUFY3Q7L099 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RUFY3Q7L099 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
RUFY3Q7L099 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
RUFY3Q7L099 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RUFY3Q7L099 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RUFY3Q7L099 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RUFY3Q7L099 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RUFY3Q7L099 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RUFY3Q7L099 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RUFY3Q7L099 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RUFY3Q7L099 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RUFY3Q7L099 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RUFY3Q7L099 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RUFY3Q7L099 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RUFY3Q7L099 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RUFY3Q7L099 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RUFY3Q7L099 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RUFY3Q7L099 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RUFY3Q7L099 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RUFY3Q7L099 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RUFY3Q7L099 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RUFY3Q7L099 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
RUFY3Q7L099 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RUFY3Q7L099 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RUFY3Q7L099 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RUFY3Q7L099 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RUFY3Q7L099 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RUFY3Q7L099 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RUFY3Q7L099 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RUFY3Q7L099 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RUFY3Q7L099 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RUFY3Q7L099 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RUFY3Q7L099 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
RUFY3Q7L099 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RUFY3Q7L099 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RUFY3Q7L099 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RUFY3Q7L099 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RUFY3Q7L099 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RUFY3Q7L099 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RUFY3Q7L099 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RUFY3Q7L099 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RUFY3Q7L099 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RUFY3Q7L099 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RUFY3Q7L099 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
RUFY3Q7L099 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RUFY3Q7L099 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RUFY3Q7L099 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RUFY3Q7L099 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
RUFY3Q7L099 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RUFY3Q7L099 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RUFY3Q7L099 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RUFY3Q7L099 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RUFY3Q7L099 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RUFY3Q7L099 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RUFY3Q7L099 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RUFY3Q7L099 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms