Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC80Q76M96 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC80Q76M96 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC80Q76M96 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC80Q76M96 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC80Q76M96 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC80Q76M96 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC80Q76M96 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC80Q76M96 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC80Q76M96 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC80Q76M96 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC80Q76M96 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC80Q76M96 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC80Q76M96 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC80Q76M96 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC80Q76M96 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC80Q76M96 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC80Q76M96 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC80Q76M96 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC80Q76M96 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC80Q76M96 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC80Q76M96 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC80Q76M96 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC80Q76M96 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC80Q76M96 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC80Q76M96 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC80Q76M96 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC80Q76M96 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC80Q76M96 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC80Q76M96 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC80Q76M96 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC80Q76M96 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC80Q76M96 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC80Q76M96 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC80Q76M96 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC80Q76M96 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC80Q76M96 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC80Q76M96 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC80Q76M96 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC80Q76M96 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC80Q76M96 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC80Q76M96 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC80Q76M96 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC80Q76M96 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC80Q76M96 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC80Q76M96 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC80Q76M96 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC80Q76M96 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC80Q76M96 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC80Q76M96 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC80Q76M96 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC80Q76M96 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC80Q76M96 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC80Q76M96 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC80Q76M96 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC80Q76M96 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC80Q76M96 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC80Q76M96 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC80Q76M96 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC80Q76M96 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC80Q76M96 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC80Q76M96 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC80Q76M96 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC80Q76M96 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC80Q76M96 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC80Q76M96 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC80Q76M96 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC80Q76M96 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC80Q76M96 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC80Q76M96 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC80Q76M96 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC80Q76M96 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC80Q76M96 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC80Q76M96 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC80Q76M96 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC80Q76M96 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC80Q76M96 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC80Q76M96 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC80Q76M96 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC80Q76M96 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC80Q76M96 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC80Q76M96 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC80Q76M96 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC80Q76M96 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC80Q76M96 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC80Q76M96 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC80Q76M96 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC80Q76M96 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC80Q76M96 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC80Q76M96 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC80Q76M96 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC80Q76M96 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC80Q76M96 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC80Q76M96 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC80Q76M96 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC80Q76M96 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC80Q76M96 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC80Q76M96 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC80Q76M96 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC80Q76M96 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms